Crystal structure determination of bis-dimethyl heptamethine cyanine chloride, C11N2H19Cl · 4 H2O
Mr = 286.59, monoclinic superposition structure C 121, Z = 4, a = 15.248(3), b = = 6.942 (3), c = 9.074(1) Å, β = 120.1(1)°, V = 827(1) Å3, Dm = 1.13(1) Mg m−3, Dx = = 1.15 Mg m−3, λ(MoKα) = 0.71069 Å, μ = 0.243 mm−1, F (000) = 312, T = 296 K, final R = 0.061 for 802 reflections. All hydrogen atoms...
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Veröffentlicht in: | Crystal research and technology (1979) 1987-03, Vol.22 (3), p.375-379 |
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Hauptverfasser: | , , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | eng |
Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | Mr = 286.59, monoclinic superposition structure C 121, Z = 4, a = 15.248(3), b = = 6.942 (3), c = 9.074(1) Å, β = 120.1(1)°, V = 827(1) Å3, Dm = 1.13(1) Mg m−3, Dx = = 1.15 Mg m−3, λ(MoKα) = 0.71069 Å, μ = 0.243 mm−1, F (000) = 312, T = 296 K, final R = 0.061 for 802 reflections. All hydrogen atoms were located. The structure consists of chloride anions, bis‐dimethyl heptamethine cyanine cations and water molecules. The structure of bis‐dimethyl heptamethine cyanine chloride is disordered, e.g. there exist partial coincidence operations, leading to more than one stacking mode of the bis‐dimethyl heptamethin cyanine chains. The crystal structure consists of rows of molecule along the a‐axis. The CC bonds show the bond length compensation, typical of polymethines, towards a partial double bond (mean value 1.38 Å) between formally sp2‐hybridized C atoms. The CN bond lengths to the methyl carbon atoms (mean value 1.49 Å) correspond to normal CN single bonds. The valence angles at the C atoms of the heptamethine chain clearly alternate and deviate systematically from 120°. This is also observed in other structures of a similar type.
The structure determined by X‐ray analysis confirms the chemical results.
Mr = 286.59, monokline Raumgruppe der Überlagerungsstruktur C 121. Z = 4, a = 15,248(3), b = 6,942(3), c = 9,074(1) Å, β = 120,1(1)°, V = 827(1) Å3, Dm = = 1.13(1) Mg m−2, Dx = 1,15 Mg m−3, λ(MoKα) = 0,71069 Å, μ = 0,243 mm−1, F (000) = = 312, T = 296 K, R‐Wert = 0,061 für 802 Reflexe. Alle Wasserstoffatome wurden lokalisiert. Die Struktur besteht aus Chloranionen, Bis‐dimethyl‐heptamethin‐cyanin‐Kationen und Wassermolekülen. Die Struktur des Bis‐dimethyl‐heptamethin‐Chlorids ist fehlgeordnet, d. h., es existieren partielle Deckoperationen, die zu keiner eindeutigen Stapelung der Bis‐dimethyl‐heptamethin‐cyanin‐Ketten führen. Die CC‐Bindungen zeigen den für Polymethine typischen Bindungslängenausgleich in Richtung auf eine partielle Doppelbindung (1,39 Å) zwischen formal sp2‐hybridisierten C‐Atomen. Die CN‐Bindungslängen zu den Methyl‐Kohlenstoffatomen (Mittelwert 1,49 Å) entsprechen normalen CN‐Einfachbindungen. Die Valenzwinkel an den Kohlenstoffatomen der Heptamethinkette zeigen deutliche Alternierung und weichen systematisch von 120° ab. Das wird auch an anderen ähnlichen Strukturen beobachtet.
Die Ergebnisse der Röntgenkristallstrukturanalyse stimmen mit den chemischen Resultaten überein. |
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ISSN: | 0232-1300 1521-4079 |
DOI: | 10.1002/crat.2170220315 |