芥蓝Aux/IAA家族基因生物信息学与表达分析
S635.9; 为更好地理解芥蓝生长素(indole-3-acetic acid,IAA)的响应途径及揭示Aux/IAA基因家族在芥蓝生长和抗盐胁迫中的功能,本研究利用生物信息学的方法从芥蓝基因组中鉴定到了41个Aux/IAA家族基因.系统进化分析结果表明,芥蓝Aux/IAA基因家族成员分布于9条染色体上,在染色体C01和C05上分布的基因最多,各有6个;该家族基因编码的蛋白质的氨基酸残基数在128~427之间,大多数为亲水性蛋白,仅有2个疏水性蛋白.亚细胞定位预测结果表明,Aux/IAA家族成员多位于细胞质、细胞核和叶绿体上.实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitat...
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Veröffentlicht in: | 浙江大学学报(农业与生命科学版) 2021, Vol.47 (3), p.314-324 |
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Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | S635.9; 为更好地理解芥蓝生长素(indole-3-acetic acid,IAA)的响应途径及揭示Aux/IAA基因家族在芥蓝生长和抗盐胁迫中的功能,本研究利用生物信息学的方法从芥蓝基因组中鉴定到了41个Aux/IAA家族基因.系统进化分析结果表明,芥蓝Aux/IAA基因家族成员分布于9条染色体上,在染色体C01和C05上分布的基因最多,各有6个;该家族基因编码的蛋白质的氨基酸残基数在128~427之间,大多数为亲水性蛋白,仅有2个疏水性蛋白.亚细胞定位预测结果表明,Aux/IAA家族成员多位于细胞质、细胞核和叶绿体上.实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)结果表明,芥蓝Aux/IAA基因家族部分成员对生长素(IAA)、脱落酸(abscisic acid,ABA)、油菜素内酯(brassinosteroids,BR)处理存在不同程度的响应,说明芥蓝Aux/IAA基因家族很可能参与植物激素信号的传导.此外,经过盐胁迫处理后,芥蓝BoIAA19-1与BoIAA2-1的表达量在处理前期均显著上调,预示Aux/IAA基因在芥蓝响应逆境的过程中也可能发挥作用.本研究结果为进一步研究Aux/IAA基因家族在芥蓝生长和抗性平衡中的功能奠定了理论基础. |
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ISSN: | 1008-9209 |
DOI: | 10.3785/j.issn.1008-9209.2020.10.221 |