肝炎基因诊断芯片对丙型肝炎病毒基因分型检测的初步研究

目的 研究丙型肝炎病毒（HCV）基因分型诊断芯片的制备和其对丙型肝炎患者血清HCVRNA基因分型诊断的准确性。方法 根据丙型肝炎病毒5′端非编码区末端（5UTR）和C区设计引物和特异性探针，将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后，配制成浓度为50μmol/ml的点样液，用点样仪点到特殊处理的玻片介质上，制成丙型肝炎病毒基因分型诊断芯片，收集HCVRNA阳性的丙型肝炎患者血清60份作为实验组，健康人血清60份作为对照组，用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCVRNA定量检测，实验组血清HCVRNA含量均大于500拷贝/ml，对照组血清HCVRNA含量均小地500拷贝/ml，两组血清进行HCVRNA分离纯化，逆转录反应，巢式PCR扩增后，分别用基因芯片，HCVRNA核酸序列测定法（美国Li-Cor核酸序列测定仪）进行双盲丙型肝炎基因分型检测。结果 实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性；基因分型；1b型46例，3a型3例。3b型3例，2a型2例，2b型2例，混合型1b+2a2例。1b+3b型2例；核酸序列测定分型1b型50例，3a型3例，3b型3例，2a型2例，2b型2例；基因诊断芯片检测和核酸序列测定检测的基因分型结果符合率为93.3%。对照组血清基因芯片检测匀阴性。结论 肝炎病毒基因诊断芯片可以用于检测血清HCVRNA，并进行基因诊断分型，准确率较率。