肾综合征出血热患者流产胎儿分离毒株84FLi的全基因序列分析

目的：克隆和测定汉滩病毒疫苗生产株84FLi的全基因组序列，了解其分子基础。方法：采用逆转录聚合酶链反应（RT－PCR），分节段扩增84FLi株L、M和S基因片段的cDNA，直接用PCR产物或克隆人pMD18-T载体后进行测序。结果：84FLi株L、M、S3个片段的全基因组序列为6533，3616和1688个核苷酸，分别编码2151，1135，429个氨基酸。A、C、G、T4种核苷酸分别为3830，2050，2510和3447个，GC含量为38．52％，AT含量为61．48％。序列同源性分析表明84FLi株与分离自广州的RG9株和分离自安徽的Chen4株高度同源。S片段核苷酸的同源性99．6％。与HTNV的国际标准毒株76－118的3个片段核苷酸同源性分别为83．7％、84．0％和87．2％，氨基酸同源性分别为97．5％、96．0％和97．9％。结论：84FLi株属于汉滩型病毒，并与分离自国内的汉滩病毒同源性较高，与中国株Chen4株和RG9株属于同一亚型。