正常肾上腺和嗜铬细胞瘤新全长基因的克隆及功能分析
目的 从正常肾上腺和嗜铬细胞瘤组织克隆新的全长cDNA并进行功能预测。方法 用表达序列标签(EST)测序、生物信息学分析、芯片拼接、cDNA末端快速护增及RT-PCR等方法检查104份来自正常肾上腺的样品及双份来自嗜铬细胞瘤的样品。结果 从肾上腺细胞文库中克隆全长cDNA126条,其中从正常肾上腺(AD)中克隆104条,嗜铬细胞瘤(PC)22条,通过测序获得克隆50条,电子克隆77条。2条通过RACE获得全长。95条经UniGene查询或放射杂交法(RH)作了染色体定位,根据预测功能其中包括一些重要的功能基因,包括信号蛋白、离子通道相关蛋白、参与激素合成酶类、分化相关蛋白、重要的转录因子及翻译...
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Veröffentlicht in: | Zhong hua yi xue za zhi 2002, Vol.82 (1), p.31-34 |
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1. Verfasser: | |
Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | 目的 从正常肾上腺和嗜铬细胞瘤组织克隆新的全长cDNA并进行功能预测。方法 用表达序列标签(EST)测序、生物信息学分析、芯片拼接、cDNA末端快速护增及RT-PCR等方法检查104份来自正常肾上腺的样品及双份来自嗜铬细胞瘤的样品。结果 从肾上腺细胞文库中克隆全长cDNA126条,其中从正常肾上腺(AD)中克隆104条,嗜铬细胞瘤(PC)22条,通过测序获得克隆50条,电子克隆77条。2条通过RACE获得全长。95条经UniGene查询或放射杂交法(RH)作了染色体定位,根据预测功能其中包括一些重要的功能基因,包括信号蛋白、离子通道相关蛋白、参与激素合成酶类、分化相关蛋白、重要的转录因子及翻译启始因子等。7个由不同剪切方式而产生的新全长cDNA。表明在体内mRNA成熟过程中剪切方式的多样性及复杂性。结论 通过大规模EST测序结合生物信息学手段可在较短时间内从肾上腺组织文库中克隆127条新的全长cDNA,其中有些可能在肾上腺功能调控以及肿瘤发生中发挥重要作用。 |
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ISSN: | 0376-2491 |
DOI: | 10.3760/j:issn:0376-2491.2002.01.009 |