新生儿常见感染病原菌的16SrDNA寡核苷酸阵列快速诊断

目的探讨PCR结合寡核苷酸阵列杂交快速诊断常见新生儿感染病原细菌方法. 方法通过对40多种常见病原菌的16SrDNA序列比较分析,在中间找到一段两端高度保守中间相对变异的序列.依据其保守序列设计一对通用引物,用于扩增细菌16SrDNA目的基因.同时依据相对变异区域的序列设计常见的8种病原细菌的探针,阵列于带正电的尼龙膜上,与通用引物的PCR产物杂交,在一个反应体系中1次可检测出标本中可能存在的常见致病菌.结果设计的通用引物能有效扩增出常见的细菌目的序列.实验结果表明寡核苷酸阵列均能特异地与其检测细菌的通用引物PCR产物杂交,而不与其它所试细菌通用引物PCR产物杂交,说明探针具有很强的特异性.进...

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Veröffentlicht in:中华儿科杂志 2004, Vol.42 (9), p.668-672
Hauptverfasser: 沈德新, 杜江, 封志纯
Format: Artikel
Sprache:chi
Online-Zugang:Volltext
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Beschreibung
Zusammenfassung:目的探讨PCR结合寡核苷酸阵列杂交快速诊断常见新生儿感染病原细菌方法. 方法通过对40多种常见病原菌的16SrDNA序列比较分析,在中间找到一段两端高度保守中间相对变异的序列.依据其保守序列设计一对通用引物,用于扩增细菌16SrDNA目的基因.同时依据相对变异区域的序列设计常见的8种病原细菌的探针,阵列于带正电的尼龙膜上,与通用引物的PCR产物杂交,在一个反应体系中1次可检测出标本中可能存在的常见致病菌.结果设计的通用引物能有效扩增出常见的细菌目的序列.实验结果表明寡核苷酸阵列均能特异地与其检测细菌的通用引物PCR产物杂交,而不与其它所试细菌通用引物PCR产物杂交,说明探针具有很强的特异性.进一步采用寡核苷酸阵列对临床分离的菌株进行鉴定,以细菌自动鉴定仪做对比,结果表明寡核苷酸阵列能检出常见的8种病原菌.结论 PCR结合寡核苷酸阵列杂交是快速诊断常见新生儿感染病原菌有效方法.
ISSN:0578-1310
DOI:10.3760/j.issn:0578-1310.2004.09.007