生物信息学分析脓毒症大鼠肝组织基因表达变化

目的 应用RNA-seq技术检测脓毒症大鼠24、48 h肝组织基因的表达变化,分析脓毒性肝损伤可能的机制.方法 随机将30只Wistar大鼠等分为脓毒症组和对照组.脓毒症组采用盲肠结扎穿孔术(CLP)建模,对照组仅行开腹、关腹.两组术毕均肌肉注射平衡液5 mL/kg.术后24、48 h各组随机取5只大鼠取肝组织提取总RNA后采用RNA-seq进行mRNA检测,应用生物信息学软件分析脓毒症大鼠肝组织mRNA随时间变化的表达差异及涉及的相关通路.结果 大鼠建模后24、48 h,相对于对照组,脓毒症大鼠肝脏组织mRNA表达上调数分别为1220个、914个,下调数分别为1741个、822个.其中脓毒症大鼠肝组织随时间变化,NF-κB、信号通路、PPAR信号通路相关mRNA表达差异明显.脓毒症大鼠24h肝组织NF-κB信号通路相关基因正常表达,而48 h转为上调有13个,下调转正常表达有4个,下调转上调有1个,上调转下调有1个,上调转为正常表达有4个,正常表达转为下调有6个,同时上调有7个,同时下调有1个.PPAR信号通路相关的基因从下调转为正常表达有20个,上调转正常表达有3个,正常表达转上调有4个,同时下调有6个,同时上调有5个.结论 肝脏炎症反应、代谢改变可能是脓毒性肝损伤的重要机制之一,可能跟NF-κB、P信号通路、PAR信号通路相关基因表达有关.