滑桃树不同器官伴生细菌多样性的分子特征

应用不依赖于培养的16S rRNA基因技术，揭示滑桃树根皮、茎皮以及种子伴生细菌的种类多样性，为建立伴生细菌的宏基因组文库奠定基础。基于我们新近发表的植物伴生菌富集方法，建立富集和未富集样品的全长16S rRNA基因文库，随机挑取至少100个克隆进行酶切分型并测序，根据16S rDNA的部分序列推测其所属伴生菌的种类。结果表明，所检测的细菌克隆大部分属于γ-Proteobacteria，有少量来源于α-Proteobacteria或放线菌（Actinobacteria），也包括不可培养或分类地位不明确的细菌。经过富集，16S rRNA基因文库中细菌克隆的比例和序列多样性显著增加，根皮的伴生细菌种类最为丰富，其次是成熟种子和茎皮；幼嫩种子16S rDNA文库的细菌克隆比例较小（1．18％），说明幼嫩种子的伴生菌最少。