三七总皂苷诱导下的肝癌细胞HepG2细胞转录组测序分析

R285.5; 目的 探讨三七总皂苷处理肝癌细胞后的基因表达差异,并对其进行生物学信息分析.方法 三七总皂苷处理细胞后,用Trizol试剂提取RNA,选用Illumina TruseqTM RNA sample prep Kit方法进行文库构建、测序,最后进行差异表达基因及功能富集分析.结果 转录组测序得到对照组和处理组总的reads数分别有64025270和64179790条,过滤得到clean reads数所占比例分别为96.8％和96.7％,共检测到58233个基因,有统计学差异表达基因77个,其中上调的基因30个,下调的基因47个,GO主题占比率超过50％的基因有5种,分别为 RBM4、MYBPC1、ATP6V1B1、NUPR1、XXbac-BPG32J3.22.结论 三七总皂苷通过影响多个与肿瘤密切相关的生物学进程和信号通路,其中RBM4和NUPR1可能在三七总皂苷调控肝癌的放疗和化疗增敏过程中发挥着作用.