变性梯度凝胶电泳技术在食源性沙门氏菌分子分型中的应用研究

目的 建立基于变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis, PCR-DGGE)技术的沙门氏菌分型方法.方法 以5株代表性沙门氏菌为供试菌, 用引物对GC-rpoB1/ropB3R扩增获得目的片段后, 经变性凝胶电泳分离获得谱图, 量化分析谱带多样性及均一性, 依据菌株谱图量化相似性构建聚类分析图, 分析该技术用于沙门氏菌分型的可行性.结果 5个供试菌的PCR-DGGE谱图差异大,其中以标准菌株肠炎沙门氏菌(ATCC 9184)的多样性及丰富度最高, 标准菌株鼠伤寒沙门氏菌的最低; 就谱带相似性而言, 分离自鸭腿样品的2株沙门氏菌的相似性最高, 戴斯系数高达85.7%, 而分属于不同血清型的两个标准菌株则相似度指数为0%; 基于谱带相似性建立的聚类树可将供试菌株很好地分为不同簇.结论 本研究所建立的基于 PCR-DGGE 技术的沙门氏菌分型方法准确度和分辨力均较理想, 具有一定的理论及实际意义.