基于粪便DNA的青海雪豹种群遗传结构初步研究
雪豹是国际关注的全球濒危物种,由于独特的生活习性,其确切分布区、种群数量和遗传结构信息非常有限,基于粪便DNA分析技术的发展为该物种的研究提供了新的手段。在青海省都兰县宗加乡、诺木红乡和治多县索加乡收集到106份疑似雪豹粪便样品,成功地扩增了78份粪便样品的mtDNA Cyt b基因片段,并进行测序。经过GenBank数据库的Blastn比对,确定了21份为雪豹粪便,其中宗加乡11份、诺木红乡5份、索加乡5份。经过Clustal W和DNASP软件比对分析,在21份雪豹粪便DNA中,共检测出7个多态性位点,分为4个单倍型,单倍型多态性(h)为0.384,核苷酸多态性(π)为0.35%。三个样地...
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Veröffentlicht in: | Shou lei xuebao 2009, Vol.29 (3), p.310-315 |
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1. Verfasser: | |
Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
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Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | 雪豹是国际关注的全球濒危物种,由于独特的生活习性,其确切分布区、种群数量和遗传结构信息非常有限,基于粪便DNA分析技术的发展为该物种的研究提供了新的手段。在青海省都兰县宗加乡、诺木红乡和治多县索加乡收集到106份疑似雪豹粪便样品,成功地扩增了78份粪便样品的mtDNA Cyt b基因片段,并进行测序。经过GenBank数据库的Blastn比对,确定了21份为雪豹粪便,其中宗加乡11份、诺木红乡5份、索加乡5份。经过Clustal W和DNASP软件比对分析,在21份雪豹粪便DNA中,共检测出7个多态性位点,分为4个单倍型,单倍型多态性(h)为0.384,核苷酸多态性(π)为0.35%。三个样地之间的遗传距离为0.002~0.005,核苷酸差异为0.200—1.273。结果表明了3个取样区均有雪豹存在,且存在较丰富的遗传多态性,样地间也存在一定的遗传差异。 |
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ISSN: | 1000-1050 |
DOI: | 10.3969/j.issn.1000-1050.2009.03.011 |