子宫内膜癌中长链非编码RNA表达谱的生物信息学分析
R711.74; 目的·分析子宫内膜癌组织和正常内膜组织中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达谱.方法·分别抽提21例子宫内膜癌组织和5例正常内膜组织的RNA,利用转录组测序技术分析并筛选2组差异表达lncRNAs.对获得的差异表达lncRNAs进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析,并结合TCGA数据库对差异表达lncRNAs进行交集分析.结果·共筛选获得3060个差异表达lncRNAs,其中上调表达的有2046个,下调的有1014个.GO功...
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Veröffentlicht in: | 上海交通大学学报(医学版) 2020-06, Vol.40 (6), p.768-775 |
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Hauptverfasser: | , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | R711.74; 目的·分析子宫内膜癌组织和正常内膜组织中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达谱.方法·分别抽提21例子宫内膜癌组织和5例正常内膜组织的RNA,利用转录组测序技术分析并筛选2组差异表达lncRNAs.对获得的差异表达lncRNAs进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析,并结合TCGA数据库对差异表达lncRNAs进行交集分析.结果·共筛选获得3060个差异表达lncRNAs,其中上调表达的有2046个,下调的有1014个.GO功能分析和KEGG通路分析结果显示,这些lncRNAs与细胞黏附、免疫反应、炎症反应、细胞增殖相关,并且主要富集在PI3K-Akt信号通路、细胞黏附、细胞因子受体等通路上.交集分析显示,57个lncRNAs在测序结果和TCGA数据库中同时上调或下调.结论·lncRNAs在子宫内膜癌和正常内膜组织中的表达有显著差异,提示其可能在子宫内膜癌的发生及发展中起到了重要作用. |
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ISSN: | 1674-8115 |
DOI: | 10.3969/j.issn.1674-8115.2020.06.010 |