子宫内膜癌中长链非编码RNA表达谱的生物信息学分析

R711.74; 目的·分析子宫内膜癌组织和正常内膜组织中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达谱.方法·分别抽提21例子宫内膜癌组织和5例正常内膜组织的RNA,利用转录组测序技术分析并筛选2组差异表达lncRNAs.对获得的差异表达lncRNAs进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析,并结合TCGA数据库对差异表达lncRNAs进行交集分析.结果·共筛选获得3060个差异表达lncRNAs,其中上调表达的有2046个,下调的有1014个.GO功...

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Veröffentlicht in:上海交通大学学报(医学版) 2020-06, Vol.40 (6), p.768-775
Hauptverfasser: 建方方, 车晓霞, 冯炜炜
Format: Artikel
Sprache:chi
Online-Zugang:Volltext
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Beschreibung
Zusammenfassung:R711.74; 目的·分析子宫内膜癌组织和正常内膜组织中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达谱.方法·分别抽提21例子宫内膜癌组织和5例正常内膜组织的RNA,利用转录组测序技术分析并筛选2组差异表达lncRNAs.对获得的差异表达lncRNAs进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析,并结合TCGA数据库对差异表达lncRNAs进行交集分析.结果·共筛选获得3060个差异表达lncRNAs,其中上调表达的有2046个,下调的有1014个.GO功能分析和KEGG通路分析结果显示,这些lncRNAs与细胞黏附、免疫反应、炎症反应、细胞增殖相关,并且主要富集在PI3K-Akt信号通路、细胞黏附、细胞因子受体等通路上.交集分析显示,57个lncRNAs在测序结果和TCGA数据库中同时上调或下调.结论·lncRNAs在子宫内膜癌和正常内膜组织中的表达有显著差异,提示其可能在子宫内膜癌的发生及发展中起到了重要作用.
ISSN:1674-8115
DOI:10.3969/j.issn.1674-8115.2020.06.010