测序法筛选慢性阻塞性肺疾病尼古丁受体 CHRNB4基因外显子单核苷酸多态性

R562; 目的:寻找中国南方汉族人群尼古丁受体(CHRNB4)基因功能区与慢性阻塞性肺疾病(COPD)疾病相关的单核苷酸多态性位点(SNP)。方法:在广州地区抽取按照慢性阻塞性肺疾病全球创议(GOLD)诊断标准(扩张后FEV1/FVC<70%)确诊的汉族COPD患者120例,按年龄(±3岁)与病例频数匹配原则选取非COPD对照者120例,病例组来自广州医科大学附属市一人民医院住院及门诊患者,对照组来自门诊志愿者。抽取受试者外周血提取基因组 DNA,利用 Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih. gov/gene/)查寻 CHRNB4的全基因组序列,以Oligo6引物设计...

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Veröffentlicht in:广州医科大学学报 2016, Vol.44 (4), p.1-4
Hauptverfasser: 赵祝香, 彭芳, 何桦, 李裕军, 曾军, 赵子文
Format: Artikel
Sprache:chi
Online-Zugang:Volltext
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Beschreibung
Zusammenfassung:R562; 目的:寻找中国南方汉族人群尼古丁受体(CHRNB4)基因功能区与慢性阻塞性肺疾病(COPD)疾病相关的单核苷酸多态性位点(SNP)。方法:在广州地区抽取按照慢性阻塞性肺疾病全球创议(GOLD)诊断标准(扩张后FEV1/FVC<70%)确诊的汉族COPD患者120例,按年龄(±3岁)与病例频数匹配原则选取非COPD对照者120例,病例组来自广州医科大学附属市一人民医院住院及门诊患者,对照组来自门诊志愿者。抽取受试者外周血提取基因组 DNA,利用 Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih. gov/gene/)查寻 CHRNB4的全基因组序列,以Oligo6引物设计软件设计包括全外显子序列在内的测序引物5对,焦磷酸法 DNA测序,Bio Edit分析软件对测序序列进行比对及基因分型分析。结果:通过第一代测序,快速筛选出中国汉族人群CHRNB4外显子区3个SNP ,分别为 rs56218866、rs6743072、rs1948。其中rs56218866可引起氨基酸位点改变。结论:通过第一代测序,可以简单、快速筛选出中国南方汉族人群与尼古丁受体CHRNB4外显子功能区和COPD易感性相关的SNP位点。
ISSN:2095-9664
DOI:10.3969/j.issn.2095-9664.2016.04.01