基于高通量测序技术的102株铜绿假单胞菌耐药基因研究

R378%R446.5; 目的 通过高通量测序技术结合生物信息学分析多重耐药铜绿假单胞菌的耐药基因型.方法从246株铜绿假单胞菌中筛选出多重耐药株,采用碱裂解法提取目的菌的基因组和质粒DN A后进行高通量测序,应用生物信息学分析携带的耐药基因.结果 共检出102株多重耐药株,21株广泛耐药株只对多黏菌素B敏感.102株多重耐药铜绿假单胞菌样本经高通量测序产生reads 32088766条,长度98 nt,总测序碱基数3.1 Gb,发现了8种抗菌药物耐药类型,含有21种耐药基因型,共有16个基因存在69个核苷酸的多态位点,其中有8种基因型17个位点发生非同义突变,占总单核苷酸多态性(SN P)位...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:国际检验医学杂志 2018, Vol.39 (7), p.773-775
Hauptverfasser: 方小龙, 王莉平, 资捷, 朱国胜
Format: Artikel
Sprache:chi
Online-Zugang:Volltext
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page 775
container_issue 7
container_start_page 773
container_title 国际检验医学杂志
container_volume 39
creator 方小龙
王莉平
资捷
朱国胜
description R378%R446.5; 目的 通过高通量测序技术结合生物信息学分析多重耐药铜绿假单胞菌的耐药基因型.方法从246株铜绿假单胞菌中筛选出多重耐药株,采用碱裂解法提取目的菌的基因组和质粒DN A后进行高通量测序,应用生物信息学分析携带的耐药基因.结果 共检出102株多重耐药株,21株广泛耐药株只对多黏菌素B敏感.102株多重耐药铜绿假单胞菌样本经高通量测序产生reads 32088766条,长度98 nt,总测序碱基数3.1 Gb,发现了8种抗菌药物耐药类型,含有21种耐药基因型,共有16个基因存在69个核苷酸的多态位点,其中有8种基因型17个位点发生非同义突变,占总单核苷酸多态性(SN P)位点的24.6%.结论 运用高通量混合基因组测序技术分析多重耐药病原菌耐药基因具有可行性.
doi_str_mv 10.3969/j.issn.1673-4130.2018.07.002
format Article
fullrecord <record><control><sourceid>wanfang_jour</sourceid><recordid>TN_cdi_wanfang_journals_gwyx_lcsw201807002</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><wanfj_id>gwyx_lcsw201807002</wanfj_id><sourcerecordid>gwyx_lcsw201807002</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-wanfang_journals_gwyx_lcsw2018070023</originalsourceid><addsrcrecordid>eNpjYFAxNNAztjSz1M_SyywuztMzNDM31jUxNDbQMzIwtNAzMNczMDBiYeCEi3Mw8BYXZyYZGBhYmhuYGJhyMng8nb_rya6-l6tnvGyY9bK9_9nW7qe7-p91NTybs_75rBZDA6NnC1a9nDzn-e79Txvbn_ZOfdE870V_z4uGCS961wP1Pp294PmCKc9XbuNhYE1LzClO5YXS3Axabq4hzh665Yl5aYl56fFZ-aVFeUCZ-PTyyor4nOTicpAjDcyBTjQmSTEA845g2g</addsrcrecordid><sourcetype>Aggregation Database</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>基于高通量测序技术的102株铜绿假单胞菌耐药基因研究</title><source>Alma/SFX Local Collection</source><creator>方小龙 ; 王莉平 ; 资捷 ; 朱国胜</creator><creatorcontrib>方小龙 ; 王莉平 ; 资捷 ; 朱国胜</creatorcontrib><description>R378%R446.5; 目的 通过高通量测序技术结合生物信息学分析多重耐药铜绿假单胞菌的耐药基因型.方法从246株铜绿假单胞菌中筛选出多重耐药株,采用碱裂解法提取目的菌的基因组和质粒DN A后进行高通量测序,应用生物信息学分析携带的耐药基因.结果 共检出102株多重耐药株,21株广泛耐药株只对多黏菌素B敏感.102株多重耐药铜绿假单胞菌样本经高通量测序产生reads 32088766条,长度98 nt,总测序碱基数3.1 Gb,发现了8种抗菌药物耐药类型,含有21种耐药基因型,共有16个基因存在69个核苷酸的多态位点,其中有8种基因型17个位点发生非同义突变,占总单核苷酸多态性(SN P)位点的24.6%.结论 运用高通量混合基因组测序技术分析多重耐药病原菌耐药基因具有可行性.</description><identifier>ISSN: 1673-4130</identifier><identifier>DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2018.07.002</identifier><language>chi</language><publisher>广东省深圳市福田区妇幼保健院检验科,广东深圳,518045</publisher><ispartof>国际检验医学杂志, 2018, Vol.39 (7), p.773-775</ispartof><rights>Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Uhttp://www.wanfangdata.com.cn/images/PeriodicalImages/gwyx-lcsw/gwyx-lcsw.jpg</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,4024,27923,27924,27925</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>方小龙</creatorcontrib><creatorcontrib>王莉平</creatorcontrib><creatorcontrib>资捷</creatorcontrib><creatorcontrib>朱国胜</creatorcontrib><title>基于高通量测序技术的102株铜绿假单胞菌耐药基因研究</title><title>国际检验医学杂志</title><description>R378%R446.5; 目的 通过高通量测序技术结合生物信息学分析多重耐药铜绿假单胞菌的耐药基因型.方法从246株铜绿假单胞菌中筛选出多重耐药株,采用碱裂解法提取目的菌的基因组和质粒DN A后进行高通量测序,应用生物信息学分析携带的耐药基因.结果 共检出102株多重耐药株,21株广泛耐药株只对多黏菌素B敏感.102株多重耐药铜绿假单胞菌样本经高通量测序产生reads 32088766条,长度98 nt,总测序碱基数3.1 Gb,发现了8种抗菌药物耐药类型,含有21种耐药基因型,共有16个基因存在69个核苷酸的多态位点,其中有8种基因型17个位点发生非同义突变,占总单核苷酸多态性(SN P)位点的24.6%.结论 运用高通量混合基因组测序技术分析多重耐药病原菌耐药基因具有可行性.</description><issn>1673-4130</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2018</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNpjYFAxNNAztjSz1M_SyywuztMzNDM31jUxNDbQMzIwtNAzMNczMDBiYeCEi3Mw8BYXZyYZGBhYmhuYGJhyMng8nb_rya6-l6tnvGyY9bK9_9nW7qe7-p91NTybs_75rBZDA6NnC1a9nDzn-e79Txvbn_ZOfdE870V_z4uGCS961wP1Pp294PmCKc9XbuNhYE1LzClO5YXS3Axabq4hzh665Yl5aYl56fFZ-aVFeUCZ-PTyyor4nOTicpAjDcyBTjQmSTEA845g2g</recordid><startdate>2018</startdate><enddate>2018</enddate><creator>方小龙</creator><creator>王莉平</creator><creator>资捷</creator><creator>朱国胜</creator><general>广东省深圳市福田区妇幼保健院检验科,广东深圳,518045</general><scope>2B.</scope><scope>4A8</scope><scope>92I</scope><scope>93N</scope><scope>PSX</scope><scope>TCJ</scope></search><sort><creationdate>2018</creationdate><title>基于高通量测序技术的102株铜绿假单胞菌耐药基因研究</title><author>方小龙 ; 王莉平 ; 资捷 ; 朱国胜</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-wanfang_journals_gwyx_lcsw2018070023</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>chi</language><creationdate>2018</creationdate><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>方小龙</creatorcontrib><creatorcontrib>王莉平</creatorcontrib><creatorcontrib>资捷</creatorcontrib><creatorcontrib>朱国胜</creatorcontrib><collection>Wanfang Data Journals - Hong Kong</collection><collection>WANFANG Data Centre</collection><collection>Wanfang Data Journals</collection><collection>万方数据期刊 - 香港版</collection><collection>China Online Journals (COJ)</collection><collection>China Online Journals (COJ)</collection><jtitle>国际检验医学杂志</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>方小龙</au><au>王莉平</au><au>资捷</au><au>朱国胜</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>基于高通量测序技术的102株铜绿假单胞菌耐药基因研究</atitle><jtitle>国际检验医学杂志</jtitle><date>2018</date><risdate>2018</risdate><volume>39</volume><issue>7</issue><spage>773</spage><epage>775</epage><pages>773-775</pages><issn>1673-4130</issn><abstract>R378%R446.5; 目的 通过高通量测序技术结合生物信息学分析多重耐药铜绿假单胞菌的耐药基因型.方法从246株铜绿假单胞菌中筛选出多重耐药株,采用碱裂解法提取目的菌的基因组和质粒DN A后进行高通量测序,应用生物信息学分析携带的耐药基因.结果 共检出102株多重耐药株,21株广泛耐药株只对多黏菌素B敏感.102株多重耐药铜绿假单胞菌样本经高通量测序产生reads 32088766条,长度98 nt,总测序碱基数3.1 Gb,发现了8种抗菌药物耐药类型,含有21种耐药基因型,共有16个基因存在69个核苷酸的多态位点,其中有8种基因型17个位点发生非同义突变,占总单核苷酸多态性(SN P)位点的24.6%.结论 运用高通量混合基因组测序技术分析多重耐药病原菌耐药基因具有可行性.</abstract><pub>广东省深圳市福田区妇幼保健院检验科,广东深圳,518045</pub><doi>10.3969/j.issn.1673-4130.2018.07.002</doi></addata></record>
fulltext fulltext
identifier ISSN: 1673-4130
ispartof 国际检验医学杂志, 2018, Vol.39 (7), p.773-775
issn 1673-4130
language chi
recordid cdi_wanfang_journals_gwyx_lcsw201807002
source Alma/SFX Local Collection
title 基于高通量测序技术的102株铜绿假单胞菌耐药基因研究
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-27T10%3A56%3A54IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-wanfang_jour&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=%E5%9F%BA%E4%BA%8E%E9%AB%98%E9%80%9A%E9%87%8F%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%8A%80%E6%9C%AF%E7%9A%84102%E6%A0%AA%E9%93%9C%E7%BB%BF%E5%81%87%E5%8D%95%E8%83%9E%E8%8F%8C%E8%80%90%E8%8D%AF%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%A0%94%E7%A9%B6&rft.jtitle=%E5%9B%BD%E9%99%85%E6%A3%80%E9%AA%8C%E5%8C%BB%E5%AD%A6%E6%9D%82%E5%BF%97&rft.au=%E6%96%B9%E5%B0%8F%E9%BE%99&rft.date=2018&rft.volume=39&rft.issue=7&rft.spage=773&rft.epage=775&rft.pages=773-775&rft.issn=1673-4130&rft_id=info:doi/10.3969/j.issn.1673-4130.2018.07.002&rft_dat=%3Cwanfang_jour%3Egwyx_lcsw201807002%3C/wanfang_jour%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rft_wanfj_id=gwyx_lcsw201807002&rfr_iscdi=true