肾性高血压大鼠粪便中miRNA的差异表达及富集分析
目的 本研究旨在检测肾性高血压大鼠粪便中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路富集分析.方法 将16只SD大鼠随机分为假手术组(Sham组,8只)、模型组(Model组,8只),Sham组分离左肾动脉不结扎,Model组分离左肾动脉并用0.2 mm银夹结扎.收集粪便,并用miRNA测序筛选差异表达miRNA,对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集.结果 术后血压比较,Model组收缩压水平高于Sham组,差异有统计学意义(P<0.05).粪便miRNA差异分析中,Model组有6个差异表达的miRNA(P<0.001),其中4个上调mi...
Gespeichert in:
Veröffentlicht in: | 国际老年医学杂志 2023, Vol.44 (5), p.518-523 |
---|---|
Hauptverfasser: | , , , |
Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Online-Zugang: | Volltext |
Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
Zusammenfassung: | 目的 本研究旨在检测肾性高血压大鼠粪便中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路富集分析.方法 将16只SD大鼠随机分为假手术组(Sham组,8只)、模型组(Model组,8只),Sham组分离左肾动脉不结扎,Model组分离左肾动脉并用0.2 mm银夹结扎.收集粪便,并用miRNA测序筛选差异表达miRNA,对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集.结果 术后血压比较,Model组收缩压水平高于Sham组,差异有统计学意义(P<0.05).粪便miRNA差异分析中,Model组有6个差异表达的miRNA(P<0.001),其中4个上调miRNA(rno-miR-335-5p、rno-miR-466-3p、rno-miR-218a-5p、rno-miR-3557-3p)、2 个下调 miRNA(rno-let-7a-5p、rno-miR-200b-5p),共预测 miRNA 下游靶基因 288 个,GO 富集主要集中在蛋白质定位、NK T细胞分化和酶活性等方面;KEGG通路富集主要集中在mTOR信号通路、MAPK信号通路等.结论 在肾性高血压大鼠粪便中miRNA呈显著差异表达,其靶基因可能通过免疫细胞活化的生物学功能及mTOR和MAPK等信号通路参与高血压的发展. |
---|---|
ISSN: | 1674-7593 |
DOI: | 10.3969/j.issn.1674-7593.2023.05.002 |