环境pH对褐环粘盖牛肝菌转录组的影响

为了探明环境酸碱条件对褐环粘盖牛肝菌基因表达的影响,测序分析了生长在不同p H环境下的该菌转录组。结果发现,与生长在p H3环境下的菌丝相比,p H4、4.5、5、5.5、6、7、8条件下的菌丝,分别有743、870、1 177、1 512、1 628、3 135、2 902个基因发生了差异表达,这些差异表达基因在基因本体论数据库中分别注释到2 029、2 368、2 733、3 125、3 168、4 626、4 728个功能,在京都基因与基因组百科全书中分别定位到76、81、108、121、116、180、177个代谢途径,其中内质网对蛋白质的加工、泛醌和其他类萜醌的生物合成途径、谷胱甘肽...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:广东农业科学 2017, Vol.44 (8), p.47-54
1. Verfasser: 杨威 蒋莹 陈有君 闫伟 李立民 霍峰
Format: Artikel
Sprache:chi
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:为了探明环境酸碱条件对褐环粘盖牛肝菌基因表达的影响,测序分析了生长在不同p H环境下的该菌转录组。结果发现,与生长在p H3环境下的菌丝相比,p H4、4.5、5、5.5、6、7、8条件下的菌丝,分别有743、870、1 177、1 512、1 628、3 135、2 902个基因发生了差异表达,这些差异表达基因在基因本体论数据库中分别注释到2 029、2 368、2 733、3 125、3 168、4 626、4 728个功能,在京都基因与基因组百科全书中分别定位到76、81、108、121、116、180、177个代谢途径,其中内质网对蛋白质的加工、泛醌和其他类萜醌的生物合成途径、谷胱甘肽代谢途径、ABC transporter途径、色氨酸代谢途径和抗生素生物合成途径等途径的富集程度较高。说明环境酸碱度对褐环粘盖牛肝菌蛋白质加工及物质跨膜转运等具有很大影响。
ISSN:1004-874X
DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2017.08.008