鼻咽癌组织中GNAT1基因的表达、杂合性丢失及甲基化分析

背景与目的：在鼻咽癌中，染色体3p21．3为高频缺失区，杂合性丢失（loss of heterozygosity，LOH）分析和功能学研究都表明3p21．3区存在与鼻咽癌相关的抑瘤基因。GNAT1基因也定位于3p21．3，但在鼻咽癌中未见关于GNAT1基因的研究报道。本研究旨在探讨GNAT1基因在鼻咽癌组织中的表达、LOH及甲基化情况。方法：应用逆转录-聚合酶链式反应（reverse transcription polymerase chain reaction，RT—PCR）方法检测了33例鼻咽癌组织和15例慢性鼻咽炎组织中GNAT1基因的表达，并通过微卫星分析技术和甲基化特异性聚合酶链式反应（methylation—specific polymerase chain reaction，MSP）分析GNAT1基因LOH和启动子区甲基化情况。结果：GNAT1基因在慢性鼻咽炎组织中均稳定表达，而在72．7％（24／33）的鼻咽癌组织中表达下调或缺失，显著低于慢性鼻咽炎组织（100％，15／15）（P=0．022）；LOH分析显示鼻咽癌组织中GNAT1基因的杂合性丢失率为15％（3／20）。且LOH与基因表达存在相关性（P=0.016）；甲基化分析发现在100％的鼻咽癌组织和80％慢性鼻咽炎组织中存在GNAT1基因启动子区高甲基化。结论：GNAT1基因在鼻咽癌组织中表达下调或缺失．这一现象与GNAT1基因的LOH存在相关性．而与3021．3区基因启动子区CpG岛的甲基化可能无关。GNAT1基因的甲基化可能不是鼻咽癌的发病机制。