史氏鲟两种促性腺激素β亚基cDNA克隆及序列进化分析
Q95; 从史氏鲟(Acipenser schrenkii)脑垂体中提取总RNA,利用GeneRacerTM技术,分别克隆得到促性腺激素Ⅰ(GTHⅠ)和Ⅱ(GTHⅡ)的β亚基cDNA全长.史氏鲟GTHⅠ-β亚基cDNA全长为1 088 bp,开放阅读框为384 bp,编码128个氨基酸(Genbank序列登录号为:AY575920);GTHⅡ-β亚基cDNA全长为616 bp,开放阅读框为408 bp,编码136个氨基酸(Genbank序列登录号为:AY575921).与其他脊椎动物进行了两种基因的氨基酸序列同源性比较表明:史氏鲟GTHⅠ-β与西伯利亚鲟相似性最高,为99.1%;与硬骨鱼类中鲈...
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Veröffentlicht in: | 动物学报 2006, Vol.52 (2), p.362-375 |
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Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | Q95; 从史氏鲟(Acipenser schrenkii)脑垂体中提取总RNA,利用GeneRacerTM技术,分别克隆得到促性腺激素Ⅰ(GTHⅠ)和Ⅱ(GTHⅡ)的β亚基cDNA全长.史氏鲟GTHⅠ-β亚基cDNA全长为1 088 bp,开放阅读框为384 bp,编码128个氨基酸(Genbank序列登录号为:AY575920);GTHⅡ-β亚基cDNA全长为616 bp,开放阅读框为408 bp,编码136个氨基酸(Genbank序列登录号为:AY575921).与其他脊椎动物进行了两种基因的氨基酸序列同源性比较表明:史氏鲟GTHⅠ-β与西伯利亚鲟相似性最高,为99.1%;与硬骨鱼类中鲈形目相似性最低,为34.5%.GTHⅡ-β与西伯利亚鲟相似性为98.3%,与其他硬骨鱼类除鲈形目外都超过60%,与鸟类的相似性最低,为42.8%.两个基因成熟肽构建的MP树显示:GTHⅠ与FSH的β亚基和GTHⅡ与LH的β亚基构成两个明显的聚类.用Mega2软件计算了所比对物种间开放读码框的核苷酸遗传距离并构建了NJ树和MP树,两个基因β亚基的NJ系统树和MP系统树拓扑结构相似,鲟鱼与真骨鱼类分别聚类,共同形成硬骨鱼纲聚类,与传统分类学一致.成熟肽相似性、遗传距离和系统树分支长度显示GTHⅠ-β亚基在真骨鱼类进化速率显著快于其他脊椎动物,而LH-β亚基在羊膜动物中进化比其他脊椎动物快.暗示这两种糖蛋白基因的进化伴随物种进化而显示其功能[动物学报52(2):362-375,2006]. |
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ISSN: | 0001-7302 |
DOI: | 10.3969/j.issn.1674-5507.2006.02.017 |