Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri

Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri

Streptococcus pneumoniae, çocuk ve yetişkinlerde toplum kökenli pnömoni, menenjit, sinüzit, bronşit ve otitis media gibi enfeksiyonların önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Pnömokokların laboratuvar tanısında konvansiyonel yöntemler bazen yetersiz kalmakta ve bu durum özellikle serotiplendiril...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Mikrobiyoloji bülteni 2009, Vol.43 (1), p.11-17
Hauptverfasser: HASÇELİK, Gülşen, ŞENER, Burçin, ENGİN, Alper, ESER, Özgen, Köseoğlu
Format: Artikel
Sprache:tur
Online-Zugang:Volltext
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page 17
container_issue 1
container_start_page 11
container_title Mikrobiyoloji bülteni
container_volume 43
creator HASÇELİK, Gülşen
ŞENER, Burçin
ENGİN, Alper
ESER, Özgen, Köseoğlu
description Streptococcus pneumoniae, çocuk ve yetişkinlerde toplum kökenli pnömoni, menenjit, sinüzit, bronşit ve otitis media gibi enfeksiyonların önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Pnömokokların laboratuvar tanısında konvansiyonel yöntemler bazen yetersiz kalmakta ve bu durum özellikle serotiplendirilemeyen S.pneumoniae suşları varlığında güçlük yaratmaktadır. Bu çalışma, solunum yolu örneklerinde S.pneumoniae tanımlanmasında kullanılan klasik yöntemler ile yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (lytA) gen varlığını saptayan moleküler yöntemlerin karşılaştırılması ve izolatların serotip dağılımının belirlenmesi amacıyla planlanmıştır. Çalışmada, 2000-2006 yılları arasında pnömokoksik pnömoni tanısı almış hastaların (yaş aralığı: 1-79 yıl) solunum yolu örneklerinden izole edilen rastgele seçilmiş 62 S.pneumoniae izolatı kullanılmıştır. Tüm izolatların tanısı, Gram boyama, %5 C02'li ve normal atmosferde optokin duyarlılık testi ve safrada çözünürlük testi gibi klasik laboratuvar testleri ile konulmuştur. Kapsül tiplendirmesi, lateks aglutinasyon yöntemi (Statens Serum Institut, Denmark) ile yapılmış; bu yöntemle belirlenemeyen izolatlar için Quellung reaksiyonu (Statens Serum Institut, Denmark) yöntemi uygulanmıştır. Virülans faktörleri; pnömokok yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (JytA) gen varlığı, sırasıyla psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G) ile psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC) ve lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) ile lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primerleri kullanılarak, "in house" polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile gösterilmiştir. Altmış iki S.pneumoniae izolatının 26 ayrı kapsül serotipine sahip olduğu bulunmuş; en sık saptanan iki serotip sırasıyla serotip 14 (n= 6) ve 19A (n= 5) olarak belirlenmiştir. Dört izolatın kapsül tipi kullanılan testlerle tespit edilememiştir. Seçilen tüm izolatların %5 C02'li ve normal atmosfer ortamında optokine duyarlı ve safrada çözünür olduğu tespit edilmiş (%100) ve hepsi nin (%100) psoÂve lytA geni içerdiği saptanmıştır. S.pneumoniae'nın laboratuvar tanısı için kullanılan klasik ve moleküler yöntemler arasında fark gözlenmemiştir. Sonuç olarak, S.pneumoniae izolatlarında, özellikle "serotiplendirilemeyen" suşların kesin ve doğru laboratuvar tanısında klasik testlerin yanısıra, psaA ve/veya lytA gen bölgesine yönelik moleküler yöntemlerin uygulanmasının, sonuçların güvenilirliği açısından değer taşıdığı kanısına varılmıştır. Streptococcus pneumoniae is one of the most frequent causative agents of c
format Article
fullrecord <record><control><sourceid>ulakbim</sourceid><recordid>TN_cdi_ulakbim_primary_95666</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>95666</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-ulakbim_primary_956663</originalsourceid><addsrcrecordid>eNqFjEFKBEEMRWuh4KBzAxe5wEDLjD1TSxHFve6H2EbJVCrVVFUL3VfwNG5m5a49mEHcGz78_xLyT9yiWW83K9_49swtSzk0Nht_tfPNwn081kx9TV3quqFArzTEpIwEQVg5AE9JsArm7081QUWzKKgRi_EL2s98jCmkgALj_DXRCKiVD6RwA-8EqSbhiRXeSIWytVqcj6ValkjldzEaXLjTV5RCyz8_d5f3d0-3D6tBMDxz3PeZI-Zx76_btl3_c_4B-CJYYw</addsrcrecordid><sourcetype>Open Access Repository</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri</title><source>EZB-FREE-00999 freely available EZB journals</source><creator>HASÇELİK, Gülşen ; ŞENER, Burçin ; ENGİN, Alper ; ESER, Özgen, Köseoğlu</creator><creatorcontrib>HASÇELİK, Gülşen ; ŞENER, Burçin ; ENGİN, Alper ; ESER, Özgen, Köseoğlu</creatorcontrib><description>Streptococcus pneumoniae, çocuk ve yetişkinlerde toplum kökenli pnömoni, menenjit, sinüzit, bronşit ve otitis media gibi enfeksiyonların önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Pnömokokların laboratuvar tanısında konvansiyonel yöntemler bazen yetersiz kalmakta ve bu durum özellikle serotiplendirilemeyen S.pneumoniae suşları varlığında güçlük yaratmaktadır. Bu çalışma, solunum yolu örneklerinde S.pneumoniae tanımlanmasında kullanılan klasik yöntemler ile yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (lytA) gen varlığını saptayan moleküler yöntemlerin karşılaştırılması ve izolatların serotip dağılımının belirlenmesi amacıyla planlanmıştır. Çalışmada, 2000-2006 yılları arasında pnömokoksik pnömoni tanısı almış hastaların (yaş aralığı: 1-79 yıl) solunum yolu örneklerinden izole edilen rastgele seçilmiş 62 S.pneumoniae izolatı kullanılmıştır. Tüm izolatların tanısı, Gram boyama, %5 C02'li ve normal atmosferde optokin duyarlılık testi ve safrada çözünürlük testi gibi klasik laboratuvar testleri ile konulmuştur. Kapsül tiplendirmesi, lateks aglutinasyon yöntemi (Statens Serum Institut, Denmark) ile yapılmış; bu yöntemle belirlenemeyen izolatlar için Quellung reaksiyonu (Statens Serum Institut, Denmark) yöntemi uygulanmıştır. Virülans faktörleri; pnömokok yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (JytA) gen varlığı, sırasıyla psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G) ile psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC) ve lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) ile lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primerleri kullanılarak, "in house" polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile gösterilmiştir. Altmış iki S.pneumoniae izolatının 26 ayrı kapsül serotipine sahip olduğu bulunmuş; en sık saptanan iki serotip sırasıyla serotip 14 (n= 6) ve 19A (n= 5) olarak belirlenmiştir. Dört izolatın kapsül tipi kullanılan testlerle tespit edilememiştir. Seçilen tüm izolatların %5 C02'li ve normal atmosfer ortamında optokine duyarlı ve safrada çözünür olduğu tespit edilmiş (%100) ve hepsi nin (%100) psoÂve lytA geni içerdiği saptanmıştır. S.pneumoniae'nın laboratuvar tanısı için kullanılan klasik ve moleküler yöntemler arasında fark gözlenmemiştir. Sonuç olarak, S.pneumoniae izolatlarında, özellikle "serotiplendirilemeyen" suşların kesin ve doğru laboratuvar tanısında klasik testlerin yanısıra, psaA ve/veya lytA gen bölgesine yönelik moleküler yöntemlerin uygulanmasının, sonuçların güvenilirliği açısından değer taşıdığı kanısına varılmıştır. Streptococcus pneumoniae is one of the most frequent causative agents of community acquired pneumoniae, meningitis, sinusitis, bronchitis and otitis media both in children and adults. Conventional laboratory methods may sometimes fail to identify S. pneumoniae. The aims of this study were i) to compare the conventional methods and molecular methods which detected pneumococcal surface antigen A (psaA) and autolysin (lytA) genes; ii) to determine the serotype distribution of S. pneumoniae isolated from the respiratory samples. Randomly chosen 62 S. pneumoniae strains isolated from respiratory samples of patients with clinically proven pneumococcal pneumonia (age range: 1-79 years) between years 2000-2006, were included in the study. Classical microbiological analysis for the isolates included Gram staining, optochin sensitivity test performed in 5% CO2 and ambient air and bile solubility test. Capsular serotyping was performed by using latex particles sensitized with mono-specific typing sera (Statens Serum Institut, Denmark). Quellung reaction (Statens Serum Institut, Denmark) was used for serotyping the isolates that gave equivocal results using latex agglutination. Pneumococcal surface antigen A and autolysin genes were detected by in-house polymerase chain reaction (PCR) using psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G), psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC), lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) and lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primers. Twenty six different serotypes were detected in 62 S. pneumoniae isolates. The most prevalent capsule serotype was 14 (n= 6), followed by 19A (n= 5). Four isolates could not be typed by the available antisera. All the isolates were optochin sensitive with or without carbondioxide incubation and were bile soluble. All the isolates included in the study have harboured (100%) psaA and lytA genes. No difference was found between the classical and molecular methods for the identification of S. pneumoniae isolates. In conclusion, detection of psaA and/or lytA genes by molecular methods is of value especially in "nonserotypeable strains" when they are performed with conventional methods in clinically proven S. pneumoniae isolates.</description><identifier>ISSN: 0374-9096</identifier><language>tur</language><publisher>Mikrobiyoloji Derneği</publisher><ispartof>Mikrobiyoloji bülteni, 2009, Vol.43 (1), p.11-17</ispartof><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,776,780,4010</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>HASÇELİK, Gülşen</creatorcontrib><creatorcontrib>ŞENER, Burçin</creatorcontrib><creatorcontrib>ENGİN, Alper</creatorcontrib><creatorcontrib>ESER, Özgen, Köseoğlu</creatorcontrib><title>Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri</title><title>Mikrobiyoloji bülteni</title><description>Streptococcus pneumoniae, çocuk ve yetişkinlerde toplum kökenli pnömoni, menenjit, sinüzit, bronşit ve otitis media gibi enfeksiyonların önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Pnömokokların laboratuvar tanısında konvansiyonel yöntemler bazen yetersiz kalmakta ve bu durum özellikle serotiplendirilemeyen S.pneumoniae suşları varlığında güçlük yaratmaktadır. Bu çalışma, solunum yolu örneklerinde S.pneumoniae tanımlanmasında kullanılan klasik yöntemler ile yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (lytA) gen varlığını saptayan moleküler yöntemlerin karşılaştırılması ve izolatların serotip dağılımının belirlenmesi amacıyla planlanmıştır. Çalışmada, 2000-2006 yılları arasında pnömokoksik pnömoni tanısı almış hastaların (yaş aralığı: 1-79 yıl) solunum yolu örneklerinden izole edilen rastgele seçilmiş 62 S.pneumoniae izolatı kullanılmıştır. Tüm izolatların tanısı, Gram boyama, %5 C02'li ve normal atmosferde optokin duyarlılık testi ve safrada çözünürlük testi gibi klasik laboratuvar testleri ile konulmuştur. Kapsül tiplendirmesi, lateks aglutinasyon yöntemi (Statens Serum Institut, Denmark) ile yapılmış; bu yöntemle belirlenemeyen izolatlar için Quellung reaksiyonu (Statens Serum Institut, Denmark) yöntemi uygulanmıştır. Virülans faktörleri; pnömokok yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (JytA) gen varlığı, sırasıyla psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G) ile psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC) ve lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) ile lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primerleri kullanılarak, "in house" polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile gösterilmiştir. Altmış iki S.pneumoniae izolatının 26 ayrı kapsül serotipine sahip olduğu bulunmuş; en sık saptanan iki serotip sırasıyla serotip 14 (n= 6) ve 19A (n= 5) olarak belirlenmiştir. Dört izolatın kapsül tipi kullanılan testlerle tespit edilememiştir. Seçilen tüm izolatların %5 C02'li ve normal atmosfer ortamında optokine duyarlı ve safrada çözünür olduğu tespit edilmiş (%100) ve hepsi nin (%100) psoÂve lytA geni içerdiği saptanmıştır. S.pneumoniae'nın laboratuvar tanısı için kullanılan klasik ve moleküler yöntemler arasında fark gözlenmemiştir. Sonuç olarak, S.pneumoniae izolatlarında, özellikle "serotiplendirilemeyen" suşların kesin ve doğru laboratuvar tanısında klasik testlerin yanısıra, psaA ve/veya lytA gen bölgesine yönelik moleküler yöntemlerin uygulanmasının, sonuçların güvenilirliği açısından değer taşıdığı kanısına varılmıştır. Streptococcus pneumoniae is one of the most frequent causative agents of community acquired pneumoniae, meningitis, sinusitis, bronchitis and otitis media both in children and adults. Conventional laboratory methods may sometimes fail to identify S. pneumoniae. The aims of this study were i) to compare the conventional methods and molecular methods which detected pneumococcal surface antigen A (psaA) and autolysin (lytA) genes; ii) to determine the serotype distribution of S. pneumoniae isolated from the respiratory samples. Randomly chosen 62 S. pneumoniae strains isolated from respiratory samples of patients with clinically proven pneumococcal pneumonia (age range: 1-79 years) between years 2000-2006, were included in the study. Classical microbiological analysis for the isolates included Gram staining, optochin sensitivity test performed in 5% CO2 and ambient air and bile solubility test. Capsular serotyping was performed by using latex particles sensitized with mono-specific typing sera (Statens Serum Institut, Denmark). Quellung reaction (Statens Serum Institut, Denmark) was used for serotyping the isolates that gave equivocal results using latex agglutination. Pneumococcal surface antigen A and autolysin genes were detected by in-house polymerase chain reaction (PCR) using psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G), psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC), lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) and lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primers. Twenty six different serotypes were detected in 62 S. pneumoniae isolates. The most prevalent capsule serotype was 14 (n= 6), followed by 19A (n= 5). Four isolates could not be typed by the available antisera. All the isolates were optochin sensitive with or without carbondioxide incubation and were bile soluble. All the isolates included in the study have harboured (100%) psaA and lytA genes. No difference was found between the classical and molecular methods for the identification of S. pneumoniae isolates. In conclusion, detection of psaA and/or lytA genes by molecular methods is of value especially in "nonserotypeable strains" when they are performed with conventional methods in clinically proven S. pneumoniae isolates.</description><issn>0374-9096</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2009</creationdate><recordtype>article</recordtype><sourceid/><recordid>eNqFjEFKBEEMRWuh4KBzAxe5wEDLjD1TSxHFve6H2EbJVCrVVFUL3VfwNG5m5a49mEHcGz78_xLyT9yiWW83K9_49swtSzk0Nht_tfPNwn081kx9TV3quqFArzTEpIwEQVg5AE9JsArm7081QUWzKKgRi_EL2s98jCmkgALj_DXRCKiVD6RwA-8EqSbhiRXeSIWytVqcj6ValkjldzEaXLjTV5RCyz8_d5f3d0-3D6tBMDxz3PeZI-Zx76_btl3_c_4B-CJYYw</recordid><startdate>2009</startdate><enddate>2009</enddate><creator>HASÇELİK, Gülşen</creator><creator>ŞENER, Burçin</creator><creator>ENGİN, Alper</creator><creator>ESER, Özgen, Köseoğlu</creator><general>Mikrobiyoloji Derneği</general><scope/></search><sort><creationdate>2009</creationdate><title>Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri</title><author>HASÇELİK, Gülşen ; ŞENER, Burçin ; ENGİN, Alper ; ESER, Özgen, Köseoğlu</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-ulakbim_primary_956663</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>tur</language><creationdate>2009</creationdate><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>HASÇELİK, Gülşen</creatorcontrib><creatorcontrib>ŞENER, Burçin</creatorcontrib><creatorcontrib>ENGİN, Alper</creatorcontrib><creatorcontrib>ESER, Özgen, Köseoğlu</creatorcontrib><jtitle>Mikrobiyoloji bülteni</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>HASÇELİK, Gülşen</au><au>ŞENER, Burçin</au><au>ENGİN, Alper</au><au>ESER, Özgen, Köseoğlu</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri</atitle><jtitle>Mikrobiyoloji bülteni</jtitle><date>2009</date><risdate>2009</risdate><volume>43</volume><issue>1</issue><spage>11</spage><epage>17</epage><pages>11-17</pages><issn>0374-9096</issn><abstract>Streptococcus pneumoniae, çocuk ve yetişkinlerde toplum kökenli pnömoni, menenjit, sinüzit, bronşit ve otitis media gibi enfeksiyonların önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Pnömokokların laboratuvar tanısında konvansiyonel yöntemler bazen yetersiz kalmakta ve bu durum özellikle serotiplendirilemeyen S.pneumoniae suşları varlığında güçlük yaratmaktadır. Bu çalışma, solunum yolu örneklerinde S.pneumoniae tanımlanmasında kullanılan klasik yöntemler ile yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (lytA) gen varlığını saptayan moleküler yöntemlerin karşılaştırılması ve izolatların serotip dağılımının belirlenmesi amacıyla planlanmıştır. Çalışmada, 2000-2006 yılları arasında pnömokoksik pnömoni tanısı almış hastaların (yaş aralığı: 1-79 yıl) solunum yolu örneklerinden izole edilen rastgele seçilmiş 62 S.pneumoniae izolatı kullanılmıştır. Tüm izolatların tanısı, Gram boyama, %5 C02'li ve normal atmosferde optokin duyarlılık testi ve safrada çözünürlük testi gibi klasik laboratuvar testleri ile konulmuştur. Kapsül tiplendirmesi, lateks aglutinasyon yöntemi (Statens Serum Institut, Denmark) ile yapılmış; bu yöntemle belirlenemeyen izolatlar için Quellung reaksiyonu (Statens Serum Institut, Denmark) yöntemi uygulanmıştır. Virülans faktörleri; pnömokok yüzey antijeni A (psaA) ve otolizin (JytA) gen varlığı, sırasıyla psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G) ile psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC) ve lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) ile lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primerleri kullanılarak, "in house" polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile gösterilmiştir. Altmış iki S.pneumoniae izolatının 26 ayrı kapsül serotipine sahip olduğu bulunmuş; en sık saptanan iki serotip sırasıyla serotip 14 (n= 6) ve 19A (n= 5) olarak belirlenmiştir. Dört izolatın kapsül tipi kullanılan testlerle tespit edilememiştir. Seçilen tüm izolatların %5 C02'li ve normal atmosfer ortamında optokine duyarlı ve safrada çözünür olduğu tespit edilmiş (%100) ve hepsi nin (%100) psoÂve lytA geni içerdiği saptanmıştır. S.pneumoniae'nın laboratuvar tanısı için kullanılan klasik ve moleküler yöntemler arasında fark gözlenmemiştir. Sonuç olarak, S.pneumoniae izolatlarında, özellikle "serotiplendirilemeyen" suşların kesin ve doğru laboratuvar tanısında klasik testlerin yanısıra, psaA ve/veya lytA gen bölgesine yönelik moleküler yöntemlerin uygulanmasının, sonuçların güvenilirliği açısından değer taşıdığı kanısına varılmıştır. Streptococcus pneumoniae is one of the most frequent causative agents of community acquired pneumoniae, meningitis, sinusitis, bronchitis and otitis media both in children and adults. Conventional laboratory methods may sometimes fail to identify S. pneumoniae. The aims of this study were i) to compare the conventional methods and molecular methods which detected pneumococcal surface antigen A (psaA) and autolysin (lytA) genes; ii) to determine the serotype distribution of S. pneumoniae isolated from the respiratory samples. Randomly chosen 62 S. pneumoniae strains isolated from respiratory samples of patients with clinically proven pneumococcal pneumonia (age range: 1-79 years) between years 2000-2006, were included in the study. Classical microbiological analysis for the isolates included Gram staining, optochin sensitivity test performed in 5% CO2 and ambient air and bile solubility test. Capsular serotyping was performed by using latex particles sensitized with mono-specific typing sera (Statens Serum Institut, Denmark). Quellung reaction (Statens Serum Institut, Denmark) was used for serotyping the isolates that gave equivocal results using latex agglutination. Pneumococcal surface antigen A and autolysin genes were detected by in-house polymerase chain reaction (PCR) using psaA1 (5'-CTT TCT GCA ATC ATT CTT G), psaA2 (5'-GCC TTC TTT ACC TTG TTC TGC), lytAF (5'-ACG CAA TCT AGC AGA TGA AGC) and lytAR (5'-TGT TTG GTT GGT TAT TCG TGC) primers. Twenty six different serotypes were detected in 62 S. pneumoniae isolates. The most prevalent capsule serotype was 14 (n= 6), followed by 19A (n= 5). Four isolates could not be typed by the available antisera. All the isolates were optochin sensitive with or without carbondioxide incubation and were bile soluble. All the isolates included in the study have harboured (100%) psaA and lytA genes. No difference was found between the classical and molecular methods for the identification of S. pneumoniae isolates. In conclusion, detection of psaA and/or lytA genes by molecular methods is of value especially in "nonserotypeable strains" when they are performed with conventional methods in clinically proven S. pneumoniae isolates.</abstract><pub>Mikrobiyoloji Derneği</pub><oa>free_for_read</oa></addata></record>
fulltext fulltext
identifier ISSN: 0374-9096
ispartof Mikrobiyoloji bülteni, 2009, Vol.43 (1), p.11-17
issn 0374-9096
language tur
recordid cdi_ulakbim_primary_95666
source EZB-FREE-00999 freely available EZB journals
title Streptococcus pneumoniae klinik izolatlarının tanımlanmasında pnömokokal yüzey antijen A ve otolizin genlerinin gösterilmesinin yeri
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-02-12T16%3A50%3A28IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-ulakbim&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=Streptococcus%20pneumoniae%20klinik%20izolatlar%C4%B1n%C4%B1n%20tan%C4%B1mlanmas%C4%B1nda%20pn%C3%B6mokokal%20y%C3%BCzey%20antijen%20A%20ve%20otolizin%20genlerinin%20g%C3%B6sterilmesinin%20yeri&rft.jtitle=Mikrobiyoloji%20b%C3%BClteni&rft.au=HAS%C3%87EL%C4%B0K,%20G%C3%BCl%C5%9Fen&rft.date=2009&rft.volume=43&rft.issue=1&rft.spage=11&rft.epage=17&rft.pages=11-17&rft.issn=0374-9096&rft_id=info:doi/&rft_dat=%3Culakbim%3E95666%3C/ulakbim%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true