Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey
Türkiye'de elma yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı bölgelerde elmalarda önemli dört virüs hastalığının yaygınlık durumlarını değerlendirmek amacıyla 2004 yılının ilkbahar döneminde bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan bu örnekler Elma mozaik virüsü (Apple mosaic virus = ApMV), Elma göv...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Turkish journal of agriculture and forestry 2006, Vol.30 (4), p.241-246 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | eng |
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Volltext |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| container_end_page | 246 |
|---|---|
| container_issue | 4 |
| container_start_page | 241 |
| container_title | Turkish journal of agriculture and forestry |
| container_volume | 30 |
| creator | CAGLAYAN, Kadriye ULUBAS SERCE, Cigdem GAZEL, Mona JELKMANN, Wilhelm |
| description | Türkiye'de elma yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı bölgelerde elmalarda önemli dört virüs hastalığının yaygınlık durumlarını değerlendirmek amacıyla 2004 yılının ilkbahar döneminde bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan bu örnekler Elma mozaik virüsü (Apple mosaic virus = ApMV), Elma gövde yivlenme virüsü (Apple stem grooving virus = ASGV) ve Elma klorotik yaprak leke virüslerine (Apple Chlorotic Leaf Spot Virus = ACLSV) karşı hem ELISA hem de RT-PCR yöntemleriyle testlenmiştir. Elma gövde çukurlaşma virüsüne (Apple stem pitting virus = ASPV) karşı ise henüz ticari olarak üretilmiş antiserum bulunmadığı için sadece RT-PCR yöntemi kullanılmış ve sonuçlar kıyaslanmıştır. Toplam 174 örnek bakanlık ve üniversitelere ait olan çeşit koleksiyon bahçelerinden ve ticari bahçelerden toplanmıştır. Bu bitkilerden 126 tanesi en az bir virüs ile enfekteli olarak saptanmıştır. Hastalığın yaygınlık oranı ticari bahçelerde % 70.21 olarak saptanırken çoğunluğu çeşit bahçelerinden alınan gözlerle üretilen fidanlarla kurulmuş olan ticari bahçelerde ise enfeksiyon oranı daha yüksek olup % 75.00 olarak bulunmuştur. ACLSV, ASGV ve ASPV'nin tanılanmasında ELISA ve RT-PCR tekniklerinin kıyaslanması sonucu elde edilen bulgular, RT-PCR yöntemi ile % 8.6 oranında daha fazla sayıda bitkinin pozitif olarak saptandığını göstermiştir. Gerek çeşit gerekse ticari bahçelerde karışık enfeksiyon oldukça yaygın bulunmuştur. Karışık enfeksiyonlar içinde en yaygın olanlar sırasıyla ASPV + ACLSV (% 84.21), ASPV + ASGV (% 36.84), ACLSV + ASGV (% 26.32) ve ASPV + ApMV (% 5.26)'dir. ASPV + ASGV + ACLSV üçlü enfeksiyon oranı ise % 26.32 olarak saptanmıştır. Virüslerin herhangi biri ile enfekteli bitki örneklerinin sayısı RT-PCR ile test edildiğinde ELISA yöntemine göre daha fazla olmuştur. Bu çalışma elma virüs hastalıklarının Türkiye'nin farklı bölgelerinde özellikle de simptom göstermeyen ağaçlarda çok yaygın olduğunu ve RT-PCR yönteminin yumuşak çekirdekli meyve ağaçlarının sertifikasyon çalışmalarında başarıyla kullanılabileceğini ortaya koymuştur.
Plant samples were collected from the main apple growing provinces of Turkey in order to evaluate the incidence of 4 important apple virus diseases during spring 2004. Collected leaves and shoots were tested using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for Apple mosaic virus (ApMV), Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV). Since no commercial ant |
| doi_str_mv | 10.3906/tar-0507-13 |
| format | Article |
| fullrecord | <record><control><sourceid>ulakbim_pasca</sourceid><recordid>TN_cdi_ulakbim_primary_67501</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>67501</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-LOGICAL-p1211-e6de50f1469d845f038c81d9f3f5a6c655c8600cb9a8c0adc6baa9c69c63c5eb3</originalsourceid><addsrcrecordid>eNo9jMFLwzAYxYMoOKcnrx5y8Rj9vqVJ2-Popg4KyqzgbXxNE6jr2pK0Qv97hxPhwe_B7_EYu0V4kCnox4G8AAWxQHnGZihBCo2xPP_tIADx85JdhfAFABHCYsZWKztYM9RdyzvHXTd6Tn3fWP5d-zHYwMuJr_PN-5JTW_FtId6yLacQaAq8bnkx-r2drtmFoybYmz_O2cfTusheRP76vMmWuehxgSisrqwCh5FOqyRSDmRiEqxSJ50ibbRSJtEApkwpMUCV0SVRavQx0ihbyjm7O_2ODe3L-rDrfX0gP-10rACP-v6kewqGGuepNXX4H2GCURpDLH8ABztVnw</addsrcrecordid><sourcetype>Open Access Repository</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>article</recordtype></control><display><type>article</type><title>Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey</title><source>TÜBİTAK Scientific Journals</source><source>EZB Electronic Journals Library</source><creator>CAGLAYAN, Kadriye ; ULUBAS SERCE, Cigdem ; GAZEL, Mona ; JELKMANN, Wilhelm</creator><creatorcontrib>CAGLAYAN, Kadriye ; ULUBAS SERCE, Cigdem ; GAZEL, Mona ; JELKMANN, Wilhelm</creatorcontrib><description>Türkiye'de elma yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı bölgelerde elmalarda önemli dört virüs hastalığının yaygınlık durumlarını değerlendirmek amacıyla 2004 yılının ilkbahar döneminde bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan bu örnekler Elma mozaik virüsü (Apple mosaic virus = ApMV), Elma gövde yivlenme virüsü (Apple stem grooving virus = ASGV) ve Elma klorotik yaprak leke virüslerine (Apple Chlorotic Leaf Spot Virus = ACLSV) karşı hem ELISA hem de RT-PCR yöntemleriyle testlenmiştir. Elma gövde çukurlaşma virüsüne (Apple stem pitting virus = ASPV) karşı ise henüz ticari olarak üretilmiş antiserum bulunmadığı için sadece RT-PCR yöntemi kullanılmış ve sonuçlar kıyaslanmıştır. Toplam 174 örnek bakanlık ve üniversitelere ait olan çeşit koleksiyon bahçelerinden ve ticari bahçelerden toplanmıştır. Bu bitkilerden 126 tanesi en az bir virüs ile enfekteli olarak saptanmıştır. Hastalığın yaygınlık oranı ticari bahçelerde % 70.21 olarak saptanırken çoğunluğu çeşit bahçelerinden alınan gözlerle üretilen fidanlarla kurulmuş olan ticari bahçelerde ise enfeksiyon oranı daha yüksek olup % 75.00 olarak bulunmuştur. ACLSV, ASGV ve ASPV'nin tanılanmasında ELISA ve RT-PCR tekniklerinin kıyaslanması sonucu elde edilen bulgular, RT-PCR yöntemi ile % 8.6 oranında daha fazla sayıda bitkinin pozitif olarak saptandığını göstermiştir. Gerek çeşit gerekse ticari bahçelerde karışık enfeksiyon oldukça yaygın bulunmuştur. Karışık enfeksiyonlar içinde en yaygın olanlar sırasıyla ASPV + ACLSV (% 84.21), ASPV + ASGV (% 36.84), ACLSV + ASGV (% 26.32) ve ASPV + ApMV (% 5.26)'dir. ASPV + ASGV + ACLSV üçlü enfeksiyon oranı ise % 26.32 olarak saptanmıştır. Virüslerin herhangi biri ile enfekteli bitki örneklerinin sayısı RT-PCR ile test edildiğinde ELISA yöntemine göre daha fazla olmuştur. Bu çalışma elma virüs hastalıklarının Türkiye'nin farklı bölgelerinde özellikle de simptom göstermeyen ağaçlarda çok yaygın olduğunu ve RT-PCR yönteminin yumuşak çekirdekli meyve ağaçlarının sertifikasyon çalışmalarında başarıyla kullanılabileceğini ortaya koymuştur.
Plant samples were collected from the main apple growing provinces of Turkey in order to evaluate the incidence of 4 important apple virus diseases during spring 2004. Collected leaves and shoots were tested using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for Apple mosaic virus (ApMV), Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV). Since no commercial antiserum is available, Apple stem pitting virus (ASPV) was tested only using RT-PCR and the results were compared. A total of 174 apple samples were collected from varietal collections belonging to governmental and university institutions and also from commercial orchards. Out of 174 plants, 126 were infected by at least one virus disease. The incidence of the 4 viruses in varietal collections was 70.21%, while it was 75.00% in commercial orchards. The results obtained from the comparison of ELISA and RT-PCR in this study showed that with the RT-PCR technique 8.6% more samples were positive for ACLSV, ASGV and ASPV. Mixed infections were also very common in both varietal and commercial orchards. Among the mixed infections, the most common one was ASPV + ACLSV (84.21%), followed by ASPV + ASGV (36.84%), ACLSV + ASGV (26.32%) and ASPV + ApMV (5.26%). The incidence of the ASPV + ASGV + ACLSV combination was 26.32%. The number of plants infected with any viruses was higher when tested using RT-PCR comparing to ELISA. This study showed that apple virus diseases, especially on symptomless trees, were very common in different provinces of Turkey and RT-PCR can be successfully applied in certification programs of pome fruit trees.</description><identifier>ISSN: 1300-011X</identifier><identifier>EISSN: 1303-6173</identifier><identifier>DOI: 10.3906/tar-0507-13</identifier><language>eng</language><publisher>Ankara: Tubitak</publisher><subject>apple chlorotic leaf spot virus ; apple mosaic ilarvirus ; apple stem grooving capillovirus ; apple stem pitting virus ; apples ; Bahçe Bitkileri Ürünleri ; Biological and medical sciences ; Bitkilerin Viral, Bakteriyel ve Mantar Hastalıkları ; detection ; elma ; elma gövde yivlenme kapillovirüsü ; elma gövde çukurlaşma virüsü ; elma klorotik yaprak leke virüsü ; elma mozaik ilarvirüsü ; Fundamental and applied biological sciences. Psychology ; Horticultural Crops ; Phytopathology. Animal pests. Plant and forest protection ; Plant viruses and viroids ; polimeraz zincir reaksiyonu ; polymerase chain reaction ; saptama ; viral diseases ; viral hastalıklar ; Viral, Bacterial and Fungal Diseases of Plants ; viruses ; virüsler</subject><ispartof>Turkish journal of agriculture and forestry, 2006, Vol.30 (4), p.241-246</ispartof><rights>2006 INIST-CNRS</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,4014,27914,27915,27916</link.rule.ids><backlink>$$Uhttp://pascal-francis.inist.fr/vibad/index.php?action=getRecordDetail&idt=18149707$$DView record in Pascal Francis$$Hfree_for_read</backlink></links><search><creatorcontrib>CAGLAYAN, Kadriye</creatorcontrib><creatorcontrib>ULUBAS SERCE, Cigdem</creatorcontrib><creatorcontrib>GAZEL, Mona</creatorcontrib><creatorcontrib>JELKMANN, Wilhelm</creatorcontrib><title>Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey</title><title>Turkish journal of agriculture and forestry</title><description>Türkiye'de elma yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı bölgelerde elmalarda önemli dört virüs hastalığının yaygınlık durumlarını değerlendirmek amacıyla 2004 yılının ilkbahar döneminde bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan bu örnekler Elma mozaik virüsü (Apple mosaic virus = ApMV), Elma gövde yivlenme virüsü (Apple stem grooving virus = ASGV) ve Elma klorotik yaprak leke virüslerine (Apple Chlorotic Leaf Spot Virus = ACLSV) karşı hem ELISA hem de RT-PCR yöntemleriyle testlenmiştir. Elma gövde çukurlaşma virüsüne (Apple stem pitting virus = ASPV) karşı ise henüz ticari olarak üretilmiş antiserum bulunmadığı için sadece RT-PCR yöntemi kullanılmış ve sonuçlar kıyaslanmıştır. Toplam 174 örnek bakanlık ve üniversitelere ait olan çeşit koleksiyon bahçelerinden ve ticari bahçelerden toplanmıştır. Bu bitkilerden 126 tanesi en az bir virüs ile enfekteli olarak saptanmıştır. Hastalığın yaygınlık oranı ticari bahçelerde % 70.21 olarak saptanırken çoğunluğu çeşit bahçelerinden alınan gözlerle üretilen fidanlarla kurulmuş olan ticari bahçelerde ise enfeksiyon oranı daha yüksek olup % 75.00 olarak bulunmuştur. ACLSV, ASGV ve ASPV'nin tanılanmasında ELISA ve RT-PCR tekniklerinin kıyaslanması sonucu elde edilen bulgular, RT-PCR yöntemi ile % 8.6 oranında daha fazla sayıda bitkinin pozitif olarak saptandığını göstermiştir. Gerek çeşit gerekse ticari bahçelerde karışık enfeksiyon oldukça yaygın bulunmuştur. Karışık enfeksiyonlar içinde en yaygın olanlar sırasıyla ASPV + ACLSV (% 84.21), ASPV + ASGV (% 36.84), ACLSV + ASGV (% 26.32) ve ASPV + ApMV (% 5.26)'dir. ASPV + ASGV + ACLSV üçlü enfeksiyon oranı ise % 26.32 olarak saptanmıştır. Virüslerin herhangi biri ile enfekteli bitki örneklerinin sayısı RT-PCR ile test edildiğinde ELISA yöntemine göre daha fazla olmuştur. Bu çalışma elma virüs hastalıklarının Türkiye'nin farklı bölgelerinde özellikle de simptom göstermeyen ağaçlarda çok yaygın olduğunu ve RT-PCR yönteminin yumuşak çekirdekli meyve ağaçlarının sertifikasyon çalışmalarında başarıyla kullanılabileceğini ortaya koymuştur.
Plant samples were collected from the main apple growing provinces of Turkey in order to evaluate the incidence of 4 important apple virus diseases during spring 2004. Collected leaves and shoots were tested using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for Apple mosaic virus (ApMV), Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV). Since no commercial antiserum is available, Apple stem pitting virus (ASPV) was tested only using RT-PCR and the results were compared. A total of 174 apple samples were collected from varietal collections belonging to governmental and university institutions and also from commercial orchards. Out of 174 plants, 126 were infected by at least one virus disease. The incidence of the 4 viruses in varietal collections was 70.21%, while it was 75.00% in commercial orchards. The results obtained from the comparison of ELISA and RT-PCR in this study showed that with the RT-PCR technique 8.6% more samples were positive for ACLSV, ASGV and ASPV. Mixed infections were also very common in both varietal and commercial orchards. Among the mixed infections, the most common one was ASPV + ACLSV (84.21%), followed by ASPV + ASGV (36.84%), ACLSV + ASGV (26.32%) and ASPV + ApMV (5.26%). The incidence of the ASPV + ASGV + ACLSV combination was 26.32%. The number of plants infected with any viruses was higher when tested using RT-PCR comparing to ELISA. This study showed that apple virus diseases, especially on symptomless trees, were very common in different provinces of Turkey and RT-PCR can be successfully applied in certification programs of pome fruit trees.</description><subject>apple chlorotic leaf spot virus</subject><subject>apple mosaic ilarvirus</subject><subject>apple stem grooving capillovirus</subject><subject>apple stem pitting virus</subject><subject>apples</subject><subject>Bahçe Bitkileri Ürünleri</subject><subject>Biological and medical sciences</subject><subject>Bitkilerin Viral, Bakteriyel ve Mantar Hastalıkları</subject><subject>detection</subject><subject>elma</subject><subject>elma gövde yivlenme kapillovirüsü</subject><subject>elma gövde çukurlaşma virüsü</subject><subject>elma klorotik yaprak leke virüsü</subject><subject>elma mozaik ilarvirüsü</subject><subject>Fundamental and applied biological sciences. Psychology</subject><subject>Horticultural Crops</subject><subject>Phytopathology. Animal pests. Plant and forest protection</subject><subject>Plant viruses and viroids</subject><subject>polimeraz zincir reaksiyonu</subject><subject>polymerase chain reaction</subject><subject>saptama</subject><subject>viral diseases</subject><subject>viral hastalıklar</subject><subject>Viral, Bacterial and Fungal Diseases of Plants</subject><subject>viruses</subject><subject>virüsler</subject><issn>1300-011X</issn><issn>1303-6173</issn><fulltext>true</fulltext><rsrctype>article</rsrctype><creationdate>2006</creationdate><recordtype>article</recordtype><recordid>eNo9jMFLwzAYxYMoOKcnrx5y8Rj9vqVJ2-Popg4KyqzgbXxNE6jr2pK0Qv97hxPhwe_B7_EYu0V4kCnox4G8AAWxQHnGZihBCo2xPP_tIADx85JdhfAFABHCYsZWKztYM9RdyzvHXTd6Tn3fWP5d-zHYwMuJr_PN-5JTW_FtId6yLacQaAq8bnkx-r2drtmFoybYmz_O2cfTusheRP76vMmWuehxgSisrqwCh5FOqyRSDmRiEqxSJ50ibbRSJtEApkwpMUCV0SVRavQx0ihbyjm7O_2ODe3L-rDrfX0gP-10rACP-v6kewqGGuepNXX4H2GCURpDLH8ABztVnw</recordid><startdate>2006</startdate><enddate>2006</enddate><creator>CAGLAYAN, Kadriye</creator><creator>ULUBAS SERCE, Cigdem</creator><creator>GAZEL, Mona</creator><creator>JELKMANN, Wilhelm</creator><general>Tubitak</general><general>TÜBİTAK</general><scope>IQODW</scope></search><sort><creationdate>2006</creationdate><title>Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey</title><author>CAGLAYAN, Kadriye ; ULUBAS SERCE, Cigdem ; GAZEL, Mona ; JELKMANN, Wilhelm</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-LOGICAL-p1211-e6de50f1469d845f038c81d9f3f5a6c655c8600cb9a8c0adc6baa9c69c63c5eb3</frbrgroupid><rsrctype>articles</rsrctype><prefilter>articles</prefilter><language>eng</language><creationdate>2006</creationdate><topic>apple chlorotic leaf spot virus</topic><topic>apple mosaic ilarvirus</topic><topic>apple stem grooving capillovirus</topic><topic>apple stem pitting virus</topic><topic>apples</topic><topic>Bahçe Bitkileri Ürünleri</topic><topic>Biological and medical sciences</topic><topic>Bitkilerin Viral, Bakteriyel ve Mantar Hastalıkları</topic><topic>detection</topic><topic>elma</topic><topic>elma gövde yivlenme kapillovirüsü</topic><topic>elma gövde çukurlaşma virüsü</topic><topic>elma klorotik yaprak leke virüsü</topic><topic>elma mozaik ilarvirüsü</topic><topic>Fundamental and applied biological sciences. Psychology</topic><topic>Horticultural Crops</topic><topic>Phytopathology. Animal pests. Plant and forest protection</topic><topic>Plant viruses and viroids</topic><topic>polimeraz zincir reaksiyonu</topic><topic>polymerase chain reaction</topic><topic>saptama</topic><topic>viral diseases</topic><topic>viral hastalıklar</topic><topic>Viral, Bacterial and Fungal Diseases of Plants</topic><topic>viruses</topic><topic>virüsler</topic><toplevel>peer_reviewed</toplevel><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>CAGLAYAN, Kadriye</creatorcontrib><creatorcontrib>ULUBAS SERCE, Cigdem</creatorcontrib><creatorcontrib>GAZEL, Mona</creatorcontrib><creatorcontrib>JELKMANN, Wilhelm</creatorcontrib><collection>Pascal-Francis</collection><jtitle>Turkish journal of agriculture and forestry</jtitle></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext</fulltext></delivery><addata><au>CAGLAYAN, Kadriye</au><au>ULUBAS SERCE, Cigdem</au><au>GAZEL, Mona</au><au>JELKMANN, Wilhelm</au><format>journal</format><genre>article</genre><ristype>JOUR</ristype><atitle>Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey</atitle><jtitle>Turkish journal of agriculture and forestry</jtitle><date>2006</date><risdate>2006</risdate><volume>30</volume><issue>4</issue><spage>241</spage><epage>246</epage><pages>241-246</pages><issn>1300-011X</issn><eissn>1303-6173</eissn><abstract>Türkiye'de elma yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı bölgelerde elmalarda önemli dört virüs hastalığının yaygınlık durumlarını değerlendirmek amacıyla 2004 yılının ilkbahar döneminde bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan bu örnekler Elma mozaik virüsü (Apple mosaic virus = ApMV), Elma gövde yivlenme virüsü (Apple stem grooving virus = ASGV) ve Elma klorotik yaprak leke virüslerine (Apple Chlorotic Leaf Spot Virus = ACLSV) karşı hem ELISA hem de RT-PCR yöntemleriyle testlenmiştir. Elma gövde çukurlaşma virüsüne (Apple stem pitting virus = ASPV) karşı ise henüz ticari olarak üretilmiş antiserum bulunmadığı için sadece RT-PCR yöntemi kullanılmış ve sonuçlar kıyaslanmıştır. Toplam 174 örnek bakanlık ve üniversitelere ait olan çeşit koleksiyon bahçelerinden ve ticari bahçelerden toplanmıştır. Bu bitkilerden 126 tanesi en az bir virüs ile enfekteli olarak saptanmıştır. Hastalığın yaygınlık oranı ticari bahçelerde % 70.21 olarak saptanırken çoğunluğu çeşit bahçelerinden alınan gözlerle üretilen fidanlarla kurulmuş olan ticari bahçelerde ise enfeksiyon oranı daha yüksek olup % 75.00 olarak bulunmuştur. ACLSV, ASGV ve ASPV'nin tanılanmasında ELISA ve RT-PCR tekniklerinin kıyaslanması sonucu elde edilen bulgular, RT-PCR yöntemi ile % 8.6 oranında daha fazla sayıda bitkinin pozitif olarak saptandığını göstermiştir. Gerek çeşit gerekse ticari bahçelerde karışık enfeksiyon oldukça yaygın bulunmuştur. Karışık enfeksiyonlar içinde en yaygın olanlar sırasıyla ASPV + ACLSV (% 84.21), ASPV + ASGV (% 36.84), ACLSV + ASGV (% 26.32) ve ASPV + ApMV (% 5.26)'dir. ASPV + ASGV + ACLSV üçlü enfeksiyon oranı ise % 26.32 olarak saptanmıştır. Virüslerin herhangi biri ile enfekteli bitki örneklerinin sayısı RT-PCR ile test edildiğinde ELISA yöntemine göre daha fazla olmuştur. Bu çalışma elma virüs hastalıklarının Türkiye'nin farklı bölgelerinde özellikle de simptom göstermeyen ağaçlarda çok yaygın olduğunu ve RT-PCR yönteminin yumuşak çekirdekli meyve ağaçlarının sertifikasyon çalışmalarında başarıyla kullanılabileceğini ortaya koymuştur.
Plant samples were collected from the main apple growing provinces of Turkey in order to evaluate the incidence of 4 important apple virus diseases during spring 2004. Collected leaves and shoots were tested using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for Apple mosaic virus (ApMV), Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV). Since no commercial antiserum is available, Apple stem pitting virus (ASPV) was tested only using RT-PCR and the results were compared. A total of 174 apple samples were collected from varietal collections belonging to governmental and university institutions and also from commercial orchards. Out of 174 plants, 126 were infected by at least one virus disease. The incidence of the 4 viruses in varietal collections was 70.21%, while it was 75.00% in commercial orchards. The results obtained from the comparison of ELISA and RT-PCR in this study showed that with the RT-PCR technique 8.6% more samples were positive for ACLSV, ASGV and ASPV. Mixed infections were also very common in both varietal and commercial orchards. Among the mixed infections, the most common one was ASPV + ACLSV (84.21%), followed by ASPV + ASGV (36.84%), ACLSV + ASGV (26.32%) and ASPV + ApMV (5.26%). The incidence of the ASPV + ASGV + ACLSV combination was 26.32%. The number of plants infected with any viruses was higher when tested using RT-PCR comparing to ELISA. This study showed that apple virus diseases, especially on symptomless trees, were very common in different provinces of Turkey and RT-PCR can be successfully applied in certification programs of pome fruit trees.</abstract><cop>Ankara</cop><pub>Tubitak</pub><doi>10.3906/tar-0507-13</doi><tpages>6</tpages><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
| fulltext | fulltext |
| identifier | ISSN: 1300-011X |
| ispartof | Turkish journal of agriculture and forestry, 2006, Vol.30 (4), p.241-246 |
| issn | 1300-011X 1303-6173 |
| language | eng |
| recordid | cdi_ulakbim_primary_67501 |
| source | TÜBİTAK Scientific Journals; EZB Electronic Journals Library |
| subjects | apple chlorotic leaf spot virus apple mosaic ilarvirus apple stem grooving capillovirus apple stem pitting virus apples Bahçe Bitkileri Ürünleri Biological and medical sciences Bitkilerin Viral, Bakteriyel ve Mantar Hastalıkları detection elma elma gövde yivlenme kapillovirüsü elma gövde çukurlaşma virüsü elma klorotik yaprak leke virüsü elma mozaik ilarvirüsü Fundamental and applied biological sciences. Psychology Horticultural Crops Phytopathology. Animal pests. Plant and forest protection Plant viruses and viroids polimeraz zincir reaksiyonu polymerase chain reaction saptama viral diseases viral hastalıklar Viral, Bacterial and Fungal Diseases of Plants viruses virüsler |
| title | Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey |
| url | https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-14T17%3A43%3A15IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-ulakbim_pasca&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.genre=article&rft.atitle=Detection%20of%20four%20apple%20viruses%20by%20ELISA%20and%20RT-PCR%20assays%20in%20Turkey&rft.jtitle=Turkish%20journal%20of%20agriculture%20and%20forestry&rft.au=CAGLAYAN,%20Kadriye&rft.date=2006&rft.volume=30&rft.issue=4&rft.spage=241&rft.epage=246&rft.pages=241-246&rft.issn=1300-011X&rft.eissn=1303-6173&rft_id=info:doi/10.3906/tar-0507-13&rft_dat=%3Culakbim_pasca%3E67501%3C/ulakbim_pasca%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true |