Detection of four apple viruses by ELISA and RT-PCR assays in Turkey

Türkiye'de elma yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı bölgelerde elmalarda önemli dört virüs hastalığının yaygınlık durumlarını değerlendirmek amacıyla 2004 yılının ilkbahar döneminde bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan bu örnekler Elma mozaik virüsü (Apple mosaic virus = ApMV), Elma gövde yivlenme virüsü (Apple stem grooving virus = ASGV) ve Elma klorotik yaprak leke virüslerine (Apple Chlorotic Leaf Spot Virus = ACLSV) karşı hem ELISA hem de RT-PCR yöntemleriyle testlenmiştir. Elma gövde çukurlaşma virüsüne (Apple stem pitting virus = ASPV) karşı ise henüz ticari olarak üretilmiş antiserum bulunmadığı için sadece RT-PCR yöntemi kullanılmış ve sonuçlar kıyaslanmıştır. Toplam 174 örnek bakanlık ve üniversitelere ait olan çeşit koleksiyon bahçelerinden ve ticari bahçelerden toplanmıştır. Bu bitkilerden 126 tanesi en az bir virüs ile enfekteli olarak saptanmıştır. Hastalığın yaygınlık oranı ticari bahçelerde % 70.21 olarak saptanırken çoğunluğu çeşit bahçelerinden alınan gözlerle üretilen fidanlarla kurulmuş olan ticari bahçelerde ise enfeksiyon oranı daha yüksek olup % 75.00 olarak bulunmuştur. ACLSV, ASGV ve ASPV'nin tanılanmasında ELISA ve RT-PCR tekniklerinin kıyaslanması sonucu elde edilen bulgular, RT-PCR yöntemi ile % 8.6 oranında daha fazla sayıda bitkinin pozitif olarak saptandığını göstermiştir. Gerek çeşit gerekse ticari bahçelerde karışık enfeksiyon oldukça yaygın bulunmuştur. Karışık enfeksiyonlar içinde en yaygın olanlar sırasıyla ASPV + ACLSV (% 84.21), ASPV + ASGV (% 36.84), ACLSV + ASGV (% 26.32) ve ASPV + ApMV (% 5.26)'dir. ASPV + ASGV + ACLSV üçlü enfeksiyon oranı ise % 26.32 olarak saptanmıştır. Virüslerin herhangi biri ile enfekteli bitki örneklerinin sayısı RT-PCR ile test edildiğinde ELISA yöntemine göre daha fazla olmuştur. Bu çalışma elma virüs hastalıklarının Türkiye'nin farklı bölgelerinde özellikle de simptom göstermeyen ağaçlarda çok yaygın olduğunu ve RT-PCR yönteminin yumuşak çekirdekli meyve ağaçlarının sertifikasyon çalışmalarında başarıyla kullanılabileceğini ortaya koymuştur. Plant samples were collected from the main apple growing provinces of Turkey in order to evaluate the incidence of 4 important apple virus diseases during spring 2004. Collected leaves and shoots were tested using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for Apple mosaic virus (ApMV), Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV). Since no commercial ant