First record of a NPV isolated from Spodoptera Littoralis (Boisd.) (Lepidoptera: Noctuidae) in Turkey and its molecular identification according to the partial lef-8 gene

Spodoptera littoralis (Boisd.) (Lepidoptera: Noctuidae) Türkiye'de önemli bir zararlı olup, bir çok üründe ciddi ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Baculoviridae familyasında yer alan virüsler böceklerin spesifik patojenlerindendir. Nükleopolihedrosis virüsler (NPVs) bu familyada yer alan iki cinsten biri olup başta lepidopterler olmak üzere pek çok böcek takımından izole edilmiştir. Çalışmamızda, Türkiye'nin güney bölgelerindeki (Mersin) pamuk alanlarında beslenen Spodoptera littoralis larvalarından lokal bir NPV izole edilmiştir. Virüsün moleküler tanımlamasında polihedra'lar (occlusion body'ler [OB'ler]) böceklerden izole edilmiş ve toplam DNA ekstraksiyonu ticari bir kit kullanılarak OB'lerden gerçekleştirilmiştir. SpliNPV genomunda bulanan ve gecikmiş gen ifadesinden sorumlu genlerden biri olan tef-SPCR'la kısmi olarak çoğaltılmıştır. Bu bölgenin nükleotid dizin analizleri MWG (Ebersberg, Almanya) tarafından gerçekleştirilmiştir. Kısmi lef-8 geninin nükleotid dizinlerine göre, güncellenen gen bankalarındaki yapılan araştırmalar izolatın bir Spodoptera littoralis NPV-B varyantı olduğunu göstermiştir. Bu NPV tüm dünyada izole edilen beşinci SpliNPV-B varyantını oluşturmuş ve Türkiye için Spodoptera littoralis'ten izole edilen ilk kayıt olması sebebiyle SpliNPV-TRl izolatı olarak adlandırılmıştır. Spodoptera littoralis (Boisd.) (Lepidoptera: Noctuidae) is an important pest in Turkey and causes extensive economic losses in many cultivated crops. The viruses within the family Baculoviridae are specific pathogens of insects. The nucleopolyhedroviruses (NPVs), 1 of the 2 genera of this family, have been isolated from many insect orders, primarily from the lepidopterans. In our study, a local NPV was isolated from the larvae of Spodoptera littoralis fed in the cotton fields in southern Turkey (Mersin). For the molecular identification of the virus, polyhedra (occlusion bodies [OBs]) were isolated from insects and total DNA extraction was performed using a commercial kit from OBs. One of the genes involved in late gene expression found in the SpliNPV genome, Ief-8, was partially amplified by PCR. Nucleotide sequence analysis of this region was performed by MWG (Ebersberg, Germany). According to the nucleotide sequences of partial Ief-8, searches carried out with the updated GenBanks showed that the isolate was a Spodoptera littoralis NPV-B variant. This NPV was the fifth SpliNPV-B variant isolated worldwide and was named SpliNPV-TRl isolate as it is the firs