Akut solunum yolu enfeksiyonlu çocuk ve erişkinlerde insan bokavirus DNA'sının polimeraz zincir reaksiyonu ile saptanması

İnsan bokavirusu (Human Bocavirus; HBoV) 2005 yılında moleküler yöntemlerle tanımlanan ve Parvoviridae ailesinde sınıflandırılan yeni bir virustur. Yapılan çalışmalar, HBoV'nin solunum yolu enfeksiyonlarında rolü olduğunu işaret etmektedir. Bu çalışmada, akut solunum yolu hastalığı olan olgular...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Mikrobiyoloji bülteni 2010, Vol.44 (3), p.405-413
Hauptverfasser: MİDİLLİ, Kenan, YILMAZ, Gülden, GÜROL, Yeşim, YARIMCAM, Filiz, ISKANOVA, Baarnisa, ERGİN, Sevgi, ÖZDAMAR, Melda, TAŞTAN, Yücel, ALTAŞ, Kemal, TÜRKOĞLU, Salih
Format: Artikel
Sprache:tur
Online-Zugang:Volltext
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:İnsan bokavirusu (Human Bocavirus; HBoV) 2005 yılında moleküler yöntemlerle tanımlanan ve Parvoviridae ailesinde sınıflandırılan yeni bir virustur. Yapılan çalışmalar, HBoV'nin solunum yolu enfeksiyonlarında rolü olduğunu işaret etmektedir. Bu çalışmada, akut solunum yolu hastalığı olan olguların solunum yolu örneklerinde HBoV DNA'sının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalına başvuran ve akut solunum yolu enfeksiyonu olan 76 çocuk ve 79 erişkin olmak üzere toplam 155 hastadan alınan boğaz sürüntüsü ve/veya boğaz yıkantı örnekleri dahil edilmiştir. HBoV DNA'sı prototip HBoV st1 suşunun 1545-1835 nükleotitleri arasındaki NS1 geninin 290 baz çiftlik kısmını çoğaltan NS1 primerleri (5-'TATGGCCAAGGCAATCGTCCAAG-3', 5'-GCCGCGTGAACATGAGAAACAG-3') kullanılarak tek aşamalı "in house" polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile araştırılmıştır. Çalışmamızda, çocuk hastaların %6.5 (5/76)'inde ve erişkin hastaların %2.5 (2/79)'inde HBoV DNA'sı saptanmıştır. HBoV DNA'sının elde edildiği örneklerden üçünün DNA dizi analizi yapılmış ve prototip virus DNA'ları ile %100 homoloji gösterdiği belirlenmiştir. İstanbul ilinde akut solunum yolu enfeksiyonu geçiren çocuk ve erişkin hastalarda HBoV DNA'sının varlığının ilk kez gösterildiği bu çalışma, ülkemizdeki ilk HBoV prevalans çalışmasıdır. HBoV'nin solunum yolu hastalıkları ile ilişkisinin açıklanabilmesi için daha kapsamlı ve prospektif olarak planlanmış klinik ve moleküler çalışmalara gereksinim vardır. Human bocavirus (HBoV) which was described in 2005 by molecular techniques, is a member of Parvoviridae. The role of HBoV is being questioned in acute respiratory diseases (ARD) in many recent studies. The aim of this study was to determine the presence of HBoV DNA in the respiratory specimens of patients with ARD. A total of 155 throat swab and/or washing specimens from 76 children and 79 adults with ARD were examined. HBoV DNA was investigated by single step in-house polymerase chain reaction (PCR) using NS1 primers (5-'TATGGCCAAGGCAATCGTCCAAG-3', 5'-GCC GCGTGAACATGAGAAACAG-3') which amplify the 290 base pair region of NS1 gene located between nucleotides 1545-1835 of prototype HBoV st1 strain. HBoV DNA was detected in 5 (6.5%) of 76 children and 2 (2.5%) of 79 adults. Three sequenced samples showed 100% homology with the reference sequences. This study in which HBoV DNA was detected in children and adults with ARD, is the first
ISSN:0374-9096