From underground to sunlight: characterization of PIF target genes define novel PIF-regulated processes

El desenvolupament i creixement de les plàntules està influenciat per senyals ambientals com ara la llum o la temperatura, i per senyals internes com ara les hormones o el rellotge circadià. Les plantes utilitzen la llum com a font d'energia per a realitzar la fotosíntesis i també com a font d'informació per percebre els canvis en l'entorn que les envolta. Per aquesta raó, les plantes tenen unes proteïnes sensibles a la llum anomenades fotoreceptors, que capten la llum i envien el senyal a una xarxa de regulació gènica que desencadena respostes fotomorfogèniques durant tot el seu cicle de vida. Els estudis fets en la planta model Arabidopsis thaliana han establert que els factors de transcripció anomenats Phytochrome Interacting Factors (PIFs) juguen un paper important durant aquesta resposta, regulant l'expressió de gens involucrats en processos fotomorfogènics com per exemple: la germinació, la desetiolació, el creixement diürn, la regulació del creixement a través de la temperatura, la resposta a la fugida de l'ombra i la floració. Altres processos fisiològics regulats per aquesta xarxa gènica encara estan poc estudiats. El principal objectiu d'aquest treball és ampliar el coneixement de la xarxa de regulació gènica controlada pels PIFs durant la fotomorfogènesis i definir noves funcions regulades pels PIFs durant el desenvolupament de la planta. En primer lloc, estudis previs han demostrat que MIDA9, una fosfatasa del tipus 2C, regula la formació del ganxo apical durant la postgerminació de la plàntula en foscor. Durant la tesi hem realitzat estudis genètics per caracteritzar la funció de MIDA9 i hem establert que és necessari per a promoure el creixement asimètric en l'hipocòtil, el qual és imprescindible per la formació del ganxo apical. Per altra banda, la majoria dels treballs publicats s'han focalitzat en entendre la funció dels PIFs durant el creixement de la planta. Per contra, pocs estudis s'han centrat a descobrir altres respostes fisiològiques regulades pels PIFs durant el creixement diürn. En aquest treball hem definit que l'acumulació dels PIFs al final de la nit és necessària per a regular el moviment dels estomes. Finalment, tot i que la funció de la xarxa gènica regulada pels PIFs ha estat caracteritzada durant aquests anys, en aquesta tesi hem identificat KAT1 i MIDA9 com a nous gens regulats pels PIFs, els quals participen en la modulació del moviment dels estomes. Ja que prèviament s'ha descrit que el control del moviment dels estomes