Partial characterization of ribosomal operons of Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20

Ribosomal operons are great tools for microbe community characterization and for microorganisms relationship study, particularly in the case of the acid lactic bacteria. The ribosomal operon of the probiotic strain Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20 was partially characterized. A genomic library of this strain was constructed and the clones with partial ribosomal operon were sub-cloned using the shot-gun method for subsequent sequencing with the forward primer. The sequence analysis revealed that the 3' end of the rDNA 16S was following by the short spacer region 1 (16S-23S) and that the 3' end of the rDNA 23S was following by the short spacer region 2 (23S-5S), which preceded the rDNA 5S. In the flanking region of the rDNA 5S gene of this operon rrn, a region encoding six tRNAs was detected. Operons ribossomais têm sido instrumentos importantes na caracterização de comunidades microbianas e no estudo de relacionamentos entre microrganismos, principalmente em bactérias do ácido láctico. Operons ribossomais da linhagem probiótica, Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20, foram parcialmente caracterizados. Um banco genômico da linhagem foi construído e os clones, contendo parte do operon ribossomal, foram subclonados pelo método de "shot gun", para em seguida serem seqüenciados com primer "forward". As seqüências indicaram a presença da extremidade 3' do rDNA 16S seguida da região espaçadora curta 1 (16S-23S) e a presença da extremidade 3' do rDNA 23S seguido da região espaçadora 2 (23S-5S), que por sua vez precedia o rDNA 5S. Adjacente ao gene rDNA 5S deste operon rrn uma região codificadora de 6 tRNAs foi detectada.