Genetic Structure and Diversity of Four Chilean Sheep Breeds

Chilean sheep breeds have a significant founder effect since they descend from very few parents, in some cases population inbreeding has increased and in others there have been significant differentiation processes as compared to their original population. The objective of this study was to estimate the current status of genetic diversity in sheep herds, which comprise the main sheep breeds in Chile, using molecular methods. Animals from four breeding herds were sampled and analyzed. The breeds studied were Corriedale, Suffolk Down, Romney Marsh and Chilota, these are the predominant numerical pure breeds in Chile. From each breed population 40 animals were sampled. Genetic characterization was done using nine microsatellite molecular markers (SSR) recommended by FAO-ISAG. Results showed that in the Chilean sheep herds there are low genetic complementarities among breeds and a high risk of losing genetic diversity due to inbreeding in Chilota and Romney Marsh breeds. Las razas ovinas presentes en Chile presentan un importante efecto fundador, al descender de un reducido número de progenitores. En algunos casos se sospecha que ha aumentado el grado de consanguinidad poblacional, mientras que en otros se observan procesos significativos de diferenciación respecto a sus poblaciones de origen. El objetivo del presente estudio fue estimar el estado actual de la diversidad genética de los planteles que gestionan las principales razas utilizadas en la ganadería ovina chilena. Para ello se utilizaron las razas Corriedale, Sufolk Down, Romney Marsh y Chilota, dado que son las predominantes en Chile como poblaciones puras. Se analizaron 40 animales de cada raza, pertenecientes a cuatro planteles de reproductores. Para la caracterización genética de los animales se utilizaron nueve marcadores moleculares de tipo microsatélite (SSR) recomendados por FAO-ISAG. Los resultados indican una baja complementariedad genética entre las razas ovinas predominantes en Chile, advirtiéndose además una potencial pérdida de diversidad genética en todas las razas así como un elevado riesgo de incremento en esta pérdida por efecto de la endogamia en las razas Chilota y Romney Marsh.