Physico-chemical investigation of the mode of binding of the alkaloids 5,6-dihydroflavopereirine and sempervirine with DNA

Le processus de fixation de la 5,6-dihydroflavopéréirine et de la sempervirine au DNA a été étudié par spectrophotométrie d'absorption, dichroïsme linéaire électrique et dichroïsme circulaire, fluorescence et polarisation de fluorescence, augmentation de la viscosité du DNA linéaire ultrasonné et déroulement du DNA circulaire. Bien que les propriétés spectroscopiques des complexes formés soient semblables à celles observées pour deux autres complexes DNA-alcaloïdes étudiés dans un travail précédent et pour les composés intercalaires plans, seule la sempervirine est capable de dérouler le DNA circulaire. Cependant, cette molécule présente les caractéristiques d'une agrégation à la surface du polyion. Les différences de comportement de ces quatre alcaloïdes sont interprétées comme la conséquence d'une pénétration d'inégale importance de l'alcaloïde dans l'hélice du DNA. The mode of binding of 5,6-dihydroflavopereirine and sempervirine to DNA has been investigated by absorption spectrophotometry, circular and electric linear dichroism, fluorescence and fluorescence polarization, viscosity increase of sonicated linear DNA and circular DNA unwinding. Although the spectroscopic properties of both compounds bound to DNA resembled those reported in our previous study of DNA complexes with two other alkaloids, and observed with planar intercalating compounds, only sempervirine was able to unwind circular DNA. The latter drug however showed signs characteristic of aggregation at the surface of the polyion. The differences between the behaviours of the four alkaloids so far investigated by us are interpreted on the basis of different extent of penetration of the chromophore ring into the DNA helix.