The complete amino acid sequence of the human aldolase C isozyme derived from genomic clones

The complete protein sequence of the human aldolase C isozyme has been determined from recombinant genomic clones. A genomic fragment of 6673 base pairs was isolated and the DNA sequence determined. Aldolase protein sequences, being highly conserved, allowed the derivation of the sequence of this isozyme by comparison of open reading frames in the genomic DNA to the protein sequence of other human aldolase enzymes. The protein sequence of the third aldolase isozyme found in vertebrates, aldolase C, completes the primary structural determination for this family of isozymes. Overall, the aldolase C isozyme shared 81% amino acid homology with aldolase A and 70% homology with aldolase B. The comparisons with other aldolase isozymes revealed several aldolase C-specific residues which could be involved in its function in the brain. The data indicated that the gene structure of aldolase C is the same as other aldolase genes in birds and mammals, having nine exons separated by eight introns, all in precisely the same positions, only the intron sizes being different. Eight of these exons contain the protein coding region comprised of 363 amino acids. The entire gene is approximately 4 kilobases. La séquence protéique complète de l'aldolase C humaine a été déterminée à partir de clones génomiques. Un fragment génomique de 6673 paires de base a été isolé et la séquence de l'ADN déterminée. Comme les séquences des aldolases sont très conservées, il a été possible de déterminer celle de cette isozyme par comparaison des phases de lecture ouvertes déterminées à partir de l'ADN avec la séquence protéique d'autres aldolases humaines. La séquence protéique de la 3 e isoenzyme de l'aldolase trouvée chez les vertébrés, l'aldolase C, achève la détermination de toutes les structures primaires de cette famille d'isozymes. L'isozyme adlolase C a 81% d'homologie avec l'aldolase A et 70% avec l'aldolase B. La comparaison avec les autres aldolases met en évidence plusieurs résidus spécifiques à l'aldolase C qui pourraient être impliqués dans sa fonction dans le cerveau. Les données de séquence montrent que la structure du gène de l'aldolase C est la même que celle des gènes des autres aldolases chez les oiseaux et les mammifères avec 9 exons séparés par 8 introns, tous situés exactement à la même position, la longueur des introns étant différente. 8 de ces exons contiennent la région codant pour la protéine qui comprend 363 acides aminés. La longueur totale du gène est d'environ 4