Attempts at simulating evolution by a computer: I. Evolution of proteins under prebiotic conditions

The effect of random mutations of five identical pentapeptides that have been inserted arbitrarily along a 100 amino acid-long protein chain has been studied by computer simulation. The method used was the application of mutation probability matrix for 2 PAMs of Dayhoff (1972) repeatedly to obtain t...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:International journal of bio-medical computing 1978-05, Vol.9 (3), p.171-179
Hauptverfasser: Marzolf, Thomas R., Greller, Larry D., Erhan, Semih
Format: Artikel
Sprache:eng
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Beschreibung
Zusammenfassung:The effect of random mutations of five identical pentapeptides that have been inserted arbitrarily along a 100 amino acid-long protein chain has been studied by computer simulation. The method used was the application of mutation probability matrix for 2 PAMs of Dayhoff (1972) repeatedly to obtain the desired length of time. The results indicated that, given sufficient length of time, even the identical peptides could become drastically altered and in order to recognise them as stemming from the same origin one has to use reasonable statistical significance thresholds. L'effet des mutations au hasard de cinq pentapeptides identiques qui avaient été arbitrairement insérés le long d'une chaîne de protéine amino-acide a été étudié par simulation d'ordinateur. La méthode utilisée a été l'application de probabilité de mutation matrice pour 2 PAMs de Dayhoff (1972) répétitive pour obtenir la longueur de temps désirée. Les résultats ont indiqúè que, avec un temps donné suffisamment long, même les peptides identiques pouvaient devenir rigoureusement modifiées et de façon à les reconnaître comme provenant de la même origine on doit utiliser des seuils de signification statistiques raisonnable.
ISSN:0020-7101
DOI:10.1016/0020-7101(78)90032-6