Characterization of Aphanomyces invadans isolates using pyrolysis mass spectrometry (PyMS)

Twenty‐one isolates of Aphanomyces invadans, the fungal pathogen associated with the Asian fish disease epizootic ulcerative syndrome (EUS), were compared with other Oomycete fungi in terms of their pyrolysis mass spectrometry (PyMS) profiles. Canonical variate analysis (CVA) of the pyrolysis mass spectra distinguished the Aphanomyces species from a wide scatter of Achlya and Saprolegnia isolates. Further CVA and hierarchal cluster analysis (HCA) separated the Aphanomyces species into two main groups. The first group clustered A. invadans isolates from EUS outbreaks in Thailand, Bangladesh, Indonesia, Philippines, Australia and Japan together. However, HCA also included the crayfish plague fungus Aphanomyces astaci within this group. Non‐pathogenic Aphanomyces strains isolated from ulcerative mycosis (UM)‐affected fish were shown to be distinct from A. invadans, and instead clustered with saprophytic Aphanomyces strains to form the second group. Recently, an invasive Aphanomyces pathogen has been isolated from UM‐affected fish, but that was not tested here. This is the first report using PyMS in the study of Oomycete systematics. The technique was not sensitive enough to show any intraspecific differences, but it was considered a useful technique for the discrimination of species where taxonomic relationships are uncertain. Zusammenfassung. Einundzwanzig Isolate von Aphanomyces invadans, einem pilzartigen Krankheitserreger, der mit dem epizootischen ulzerativen Syndrom der asiatischen Fischkrankheit (EUS) assoziiert ist, wurden mit anderen Oomycetenpilzen bezüglich ihrer Profile bei der Pyrolysemassenspektrometrie (PyMS) verglichen. Die Kanonische Varianzanalyse (CVA) der Pyrolysemassenspektren unterschied die Gattung Aphanomyces von einer breiten Streuung der Arten Achlya und Saprolegnia. Eine weitere CVA und eine Hierarchische Blockanalyse (HCA) trennten die Gattung Aphanomyces in zwei Hauptgruppen. Die erste Gruppe bündelte die A. invadans‐Isolate aus EUS‐Ausbrüchen in Thailand, Bangladesh, Indonesien, den Philippinen, Australien und Japan. Jedoch schloß die HCA auch den pilzartigen Erreger der Panzerkrebspest, Aphanomyces astaci, innerhalb dieser Gruppe mit ein. Es wurde gezeigt, dass nicht‐pathogene Aphanomyces‐Stämme, die aus Fischen mit ulzerativer Mykose (UM) isoliert worden waren, sich von A. invadans unterschieden. Anstatt zusammen mit saprophytischen Aphanomyces‐Stämmen als Cluster zu erscheinen, bildeten sie die zweite Gruppe. Vor kurzem wurde