Overview and perspectives on the transcriptome of Paracoccidioides brasiliensis

Paracoccidioides brasiliensis is a dimorphic and thermo-regulated fungus which is the causative agent of paracoccidioidomycosis, an endemic disease widespread in Latin America that affects 10 million individuals. Pathogenicity is assumed to be a consequence of the dimorphic transition from mycelium to yeast cells during human infection. This review shows the results of the P. brasiliensis transcriptome project which generated 6,022 assembled groups from mycelium and yeast phases. Computer analysis using the tools of bioinformatics revealed several aspects from the transcriptome of this pathogen such as: general and differential metabolism in mycelium and yeast cells; cell cycle, DNA replication, repair and recombination; RNA biogenesis apparatus; translation and protein fate machineries; cell wall; hydrolytic enzymes; proteases; GPI-anchored proteins; molecular chaperones; insights into drug resistance and transporters; oxidative stress response and virulence. The present analysis has provided a more comprehensive view of some specific features considered relevant for the understanding of basic and applied knowledge of P. brasiliensis. Paracoccidioides brasiliensis es un hongo de dimorfismo termorregulado que es el agente causal de la paracoccidioidomicosis, una enfermedad endémica muy extendida en América Latina que afecta a 10 millones de individuos. Se asume que la patogenicidad es una consecuencia de la transición dimorfa de micelio a levadura durante la infección humana. Esta revisión muestra los resultados del proyecto de transcriptoma de P. brasiliensis, que generó 6.022 grupos ensamblados de las fases miceliar y levaduriforme. El análisis por ordenador utilizando herramientas bioinformáticas reveló varios aspectos del transcriptoma de este patógeno, como el metabolismo general y diferencial en el micelio y las levaduras, el ciclo celular, la replicación, reparación y recombinación del ADN, el aparato para la biogénesis del ARN, las maquinarias de traslación y destino de las proteínas, la pared celular, las enzimas hidrolíticas, las proteasas, las proteínas con anclaje GPI, los chaperones moleculares, el entendimiento de la resistencia a fármacos y los transportadores, la respuesta al estrés oxidativo y la virulencia. Este análisis ha proporcionado una visión más amplia de algunos aspectos específicos considerados relevantes para entender el conocimiento básico y aplicado de P. brasiliensis.