Spatio‐temporal distribution of vertically transmitted dengue viruses by Aedes aegypti (Diptera: Culicidae) from Arroyo Naranjo, Havana, Cuba

Objective To study the distribution of vertical transmission of dengue viruses in field‐collected Aedes aegypti larvae in the municipality of Arroyo Naranjo in Havana, Cuba. Methods Aedes aegypti larvae and pupae were collected monthly between September 2013 and July 2014 in the seven Municipal Health Areas of Arroyo Naranjo. Pools formed of 30–55 larvae were examined through PCR and sequencing to detect the presence of each serotype. Results We analysed 111 pools of larvae and pupae (4102 individuals) of which 37 tested positive for at least one DENV. More than one DENV type was observed in 10 of the 37 positive pools. Infected pools were detected every month, except in January, suggesting a sustained circulation of DENV in the vector populations. DENV‐1 and DENV‐3 were the most frequent and dispersed, though all four DENV types were detected. Nucleotide sequencing from positive pools confirmed RT‐PCR results for DENV‐1 (genotype V), DENV‐3 (genotype III) and DENV‐4 (genotype II). DENV‐2 was detected by RT‐PCR but could not be confirmed by nucleotide sequencing. Conclusion Our study of the distribution of natural vertical transmission of dengue virus types highlights extrinsic virus activity patterns in the area and could be used as a new surveillance tool. Objectif Etudier la répartition de la transmission verticale des virus de la dengue parmi les larves d’Aedes aegypti collectées sur le terrain dans la municipalité d'Arroyo Naranjo à La Havane, à Cuba. Méthodes Les larves et les nymphes d’Ae. aegypti ont été collectées mensuellement entre septembre 2013 et juillet 2014 dans les sept zones sanitaires municipales d'Arroyo Naranjo. Les pools formés de 30 à 55 larves ont été examinés par PCR et par séquençage pour détecter la présence de chaque sérotype. Résultats Nous avons analysé 111 pools de larves et de nymphes (4.102 individus) dont 37 étaient positifs pour au moins un DENV. Plus d'un type de DENV a été observé dans 10 des 37 pools positifs. Des pools infectés ont été détectés tous les mois, sauf en janvier, suggérant une circulation continue du DENV dans les populations de vecteurs. DENV‐1 et DENV‐3 étaient les plus fréquents et les plus dispersés, bien que tous les quatre types de DENV aient été détectés. Le séquençage des nucléotides à partir de pools positifs a confirmé les résultats de RT‐PCR pour DENV‐1 (génotype V), DENV‐3 (génotype III) et DENV‐4 (génotype II). DENV‐2 a été détecté par RT‐PCR mais n'a pas pu être confirmé par séquençage de nu