Rapid detection and typing of circulating mumps virus by reverse transcription/polymerase chain reaction

The reverse transcription/polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to amplify a 129-bp fragment of the mumps virus F gene from strains circulating in the Siena area from 1993–1995. The nucleic acid was amplified directly from the samples; no growth in cell culture was required. Nucleotide sequence analysis and the comparison with other virus strains enabled the typing of the detected viruses. There appears to be more than one lineage of mumps virus circulating at any given time in the same location. A PCR assay coupled with the sequencing of the 5′ end of the F gene seems to be a convenient method for characterizing mumps virus strains. This method, useful in diagnosis, also appears to be suitable for epidemiological studies. Avec l'étape initiale de la transcription inverse, l'ARN du virus des oreillons a été transcrit en ADN, qui a été amplifié. Cette méthode a permis de détecter une portion, parmi des amorces spécifiques, de 129 paires de bases du gène F du virus des oreillons en circulation dans les environs de Sienne au cours des années 1993–1995. L'amplification du fragment sélectionné du génome viral a été appliquée directement sur les échantillons cliniques, qui n'ont pas été utilisés pour l'infection cellulaire. Il a donc été possible d'analyser et de comparer les séquences des produits amplifiés; cela a permis de mettre en évidence une remarquable variabilité des souches en circulation. Cette technique, très utile au diagnostic des oreillons, fournit aussi de nouveaux renseignements utiles à l'épidémiologie.