Limited mitochondrial DNA variation within South Africa's black rhino (Diceros bicornis minor) population and implications for management

The taxonomy of African black rhinoceros (Diceros bicornis) remains unresolved. Maintaining levels of genetic diversity and species rescue by reintroduction and restocking requires its resolution. We compared the sequences of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region for a total of 101 D. bicornis from three subspecies: D. b. minor, D. b. michaeli and D. b. bicornis. A single unique haplotype was found within the 65 D. b. minor samples from KwaZulu‐Natal (KZN) Province, South Africa, 55 of which came from Hluhluwe‐iMfolozi Game Park (HiP) and Mkuzi Game Reserve (MGR) source populations. However, six different haplotypes were represented in eleven D. b. minor samples from Zimbabwe. Similarly, published autosomal microsatellite data indicate low levels of diversity within the KZN D. b. minor populations. The low levels of mtDNA diversity within the KZN metapopulation point to the possible need for genetic supplementation. However, there is a need to determine whether the low levels of genetic variation within KZN D. b. minor are a result of the recent bottleneck or whether KZN historically always had low diversity. Résumé La taxonomie du rhinocéros noir d'Afrique (Diceros bicornis) n'est pas encore résolue. Pour préserver le taux de diversité génétique et pouvoir sauvegarder l'espèce par des réintroductions et des repeuplements, il faut résoudre cette question. Nous avons comparé les séquences de la région de contrôle de l'ADN mitochondrial (ADNmt) d'un total de 101 D. bicornis appartenant aux trois sous‐espèces D. b. minor, D. b. michaeli et D. b. bicornis. Nous avons trouvé un seul et unique haplotype pour les 65 échantillons venant de D. b. minor de la province du KwaZulu‐Natal (KZN) en Afrique du Sud, dont 55 venaient de populations sources du Parc de Hluhluwe‐iMfolozi (HiP) et de la Réserve de Faune de Mkuzi (MGR). Par contre, il y avait six haplotypes différents dans 11 échantillons de D. b. minor venant du Zimbabwe. Les données publiées sur les microsatellites autosomaux indiquent, elles aussi, un faible taux de diversité au sein des populations de D. b. minor du KZN. Le faible taux de diversité de l'ADNmt dans la métapopulation du KZN indique un éventuel besoin de supplémentation génétique. Cependant, il faut d'abord déterminer si le faible taux de variation génétique chez les D. b. minor du KZN est un résultat des réductions récentes ou si le KZN a toujours eu une faible diversité.