CARACTERIZACIÓN PLASTÓMICA DE ESPECIES DE Paspalum (POACEAE) DEL GRUPO NOTATA

El grupo Notata s.l. del género Paspalum reúne a especies de interés forrajero que son morfológicamente muy similares entre sí y presentan diferentes niveles de ploidía en base a x=10. Se estudiaron los genomas del cloroplasto (plastomas) de seis especies del grupo, a partir del ADN genómico total. Se prepararon bibliotecas genómicas y se secuenciaron utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento (genome skimming). Las secuencias limpias fueron ensambladas de novo usando el programa NOVOplasty (versión 2.7.2) con dos tamaños de kmers (21 y 33 nucleótidos). Se logró ensamblar, circularizar y anotar siete genomas de cloroplastos de las siguientes especies: P. barretoi Canto-Dorow, Valls et Longhi-Wagner, P. cerradoense R. C. Oliveira et Valls y P. cromyorhizon Trinius ex Döll. con 2n=2x=20, P. ellipticum Döll con 2n=8x=80, P. minus E. Fourn. con 2n=5x=50, P. notatum Flüggé con 2n=2x=20 y 2n=4x=40. Los plastomas fueron anotados y visualizados utilizando los programas GESeq, IRSCREEN y OGDRAW. Las anotaciones incluyeron genes, pseudogenes y regiones invertidas entre otras. Los análisis genómicos en progreso incluyen comparaciones estructurales entre genomas, identificación de regiones propensas a mutaciones útiles para estudios poblacionales y evaluación de tipos de selección en los genes.