Genetic studies on house rot fungi and a rapid diagnosis

The paper describes genetic studies on house rot fungi and a rapid identification technique for them, viz. the true dry rot fungus Serpula lacrymans, the wild merulius S. himantioides, the cellar fungus Coniophora puteana and the pore house fungi Antrodia vaillantii and Tyromyces placenta. The method ARDRA-ITS uses the internal transcribed spacer (ITS) of the ribosomal DNA (rDNA) which is amplified by the polymerase chain reaction (PCR). Amplifications were directly performed from agar plate mycelium and even from fungal tissue taken from infected substrate in a building without preceding fungal pure cultures and DNA preparation. For fungal differentiation, the amplified rDNA-ITS region was digested with the restriction endonucleases HaeIII and TaqI and the obtained ITS fragments separated by agarose gel electrophoresis. The specific DNA-fragment fingerprint allowed the identification of an unknown fungal sample by comparison of its pattern with those of control fungi within one day from sampling to diagnosis. Beschrieben werden genetische Untersuchungen an Hausfaeulepilzen, die zu einem Schnelltest zur Diagnose von Hausschwamm, Kellerschwamm und Porenhausschwaemmen entwickelt wurden. Die Technik ARDRA-ITS basiert auf dem 'internal transcribed spacer' (ITS) der ribosomalen DNS, der mittels der Polymerase-Kettenreaktion vermehrt wurde. Zur Amplifizierung des ITS-Bereiches war Myzel ohne vorherige DNS-Reinigung direkt von Agarkulturen sowie sogar von Pilzmaterial aus einem Gebaeude ohne vorherige Reinkultivierung geeignet. Der amplifizierte ITS wurde dann mit den Restriktionsenzymen HaeIII und TaqI geschnitten und die Fragmente in Agarosegelen elektrophoretisch aufgetrennt. Die spezifischen Fragmentgroessen ermoeglichten als "Fingerabdruck" die Diagnose einer unbekannten Pilzprobe durch Vergleich ihres Musters mit denjenigen von Kontrollpilzen. Der Schnelltest kann innerhalb eines Tages durchgefuehrt werden.