A taxonomically complex catfish group from an underrepresented geographic area: Systematics and species limits in Hypostomus Lacépède, 1803 (Siluriformes, Loricariidae) from Eastern South America

Hypostomus Lacépède, 1803, is a species‐rich and widespread fish genus from the Neotropical region, but its evolutionary history and systematics remain largely unclear. In addition, species from regions with high levels of species richness and endemism such as the Northeastern Mata Atlântica (NMA) and São Francisco (SF) hydrographic freshwater ecoregions are underrepresented in phylogenetic studies so far. In this study, we performed a broad sampling of Hypostomus in NMA and SF to investigate the interspecific boundaries and phylogenetic relationships using a multilocus approach based on one mitochondrial and three nuclear markers. Seven genetic groups were found for both ecoregions, in addition to one lineage exclusive to the SF represented by populations of the species Hypostomus velhochico. Moreover, multilocus analyses validated 16 formally described species and two new lineages for the NMA and SF ecoregions, as well as putative cases of species complexes. In general, lineages with independent evolutionary histories were revealed within the same ecoregion alongside genetically related groups between NMA, SF, and other ecoregions. These data reinforce the intricate scenario of this group of Neotropical fish and are useful to outline further phylogeographic studies in Hypostomus. a Hypostomus Lacépède, 1803 es un género de peces rico en especies y ampliamente distribuido en la región Neotropical, pero su historia evolutiva y sistemática siguen siendo poco conocidas. Además, las especies de regiones con altos niveles de riqueza y endemismo de especies, como las ecorregiones de agua dulce Mata Atlántica Nordeste (NMA) y São Francisco (SF), están infrarrepresentadas en los estudios filogenéticos hasta el momento. En este estudio, realizamos un amplio muestreo de Hypostomus en la NMA y SF para investigar los límites interespecíficos y las relaciones filogenéticas utilizando un enfoque multilocus basado en un marcador mitocondrial y tres marcadores nucleares. En ambas ecorregiones se encontraron siete grupos genéticos y un linaje exclusivo del SF representado por poblaciones de la especie Hypostomus velhochico. Al mismo tiempo, los análisis multilocus validaron 16 especies formalmente descritas y dos nuevos linajes para las ecorregiones NMA y SF, así como posibles casos de complejos de especies. En general, se han revelado linajes con historias evolutivas independientes dentro de la misma ecorregión junto con grupos genéticamente relacionados entre la NMA, SF