Выявление участков ДНК, специфичных для регуляторных районов контролируемых глюкокортикоидами генов, методом компьютерного анализа

Методом компьютерного анализа исследованы нуклеотидные последовательности 12 регулируемых глюкокортикоидами генов и 21 гена, не регулируемого этими гормонами. Показано, что консенсус TGTTCT, выявленный рядом авторов во фрагментах ДНК, защищенных глюкокортикоид-рецепторными комплексами от нуклеаз, неспецифичен для глюкокортикоид-регулируемых генов. Однако только для этих генов характерна закономерность в расположении четырех остатков цитозина в районе консенсуса: один из них принадлежит самому консенсусу, три отстоят друг от друга на расстоянии 8 –10 п.н., а четвертый расположен через 6 п. н. от третьего, что обеспечивает в составе двойной спирали ДНК расположение консенсуса в тесном соседстве с двумя остатками цитозина и комплементарным четвертому цитозину остатком гуанина по одной стороне спирали. Предполагается, что гормон-рецепторный комплекс опознает этот специфичный компактный участок двойной спирали ДНК, образованный консенсусом и фланкирующими его цитозиновыми и гуаниновыми остатками.