Validation of a specific PCR screening test for Pantoea stewartii subsp. stewartii in maize (Zea mays) samples

Validation data is presented for a conventional PCR test that specifically detects the quarantine pathogen Pantoea stewartii subsp. stewartii in maize leaf and seed samples and does not cross‐react with the non‐pathogenic P. stewartii subsp. indologenes. The PCR tests currently recommended by the EPPO Diagnostic Protocol PM 7/60 (2) for initial screening bear the risk of false positives as they detect both subspecies of P. stewartii. The test presented here has high analytical sensitivity (102 cells mL–1 in leaf extracts, at least 103 cells mL−1 in seed extracts), high repeatability and high reproducibility and performed well on the two matrices tested: maize seed and leaf extract. Its improved analytical specificity and analytical sensitivity compared to the currently recommended tests lead the authors to suggest that this test should be included as a first screening test in the diagnostic protocol for P. stewartii subsp. stewartii when it is next revised. Validation d'un test de dépistage PCR spécifique pour Pantoea stewartii subsp. stewartii dans des échantillons de maïs (Zea mays) Les données de validation d'un test PCR sont présentées: ce test détecte spécifiquement l'organisme de quarantaine Pantoea stewartii subsp. stewartii sur échantillons de feuilles et de graines de maïs et ne réagit pas avec l'agent non‐pathogène P. stewartii subsp. indologenes. Les tests PCR recommandés actuellement comme premier test de dépistage par le protocole de diagnostic OEPP PM 7/60 (2) comportent un risque de faux positifs, car ils détectent les deux sous‐espèces de P. stewartii. Le test exposé ici présente une sensibilité analytique élevée (102 cellules/mL sur extraits de feuilles, au moins 103 cellules/mL sur extraits de graines), une haute répétabilité, une haute reproductibilité et a donné de bons résultats sur les deux matrices testées (extrait de graines de maïs et extrait de feuilles). Les spécificités et sensibilités analytiques améliorées de ce test par rapport aux tests actuellement recommandés amènent les auteurs à suggérer que ce test devrait être inclus comme premier test de dépistage dans le protocole de diagnostic de P. stewartii subsp. stewartii lors de sa prochaine révision. Валидация специфичного скрининг‐теста для ПЦР на выявление Pantoea stewartii subsp. stewartii в образцах кукурузы (Zea mays) Представлены данные валидации скрининг‐теста ПЦР на специфичное выявление Pantoea stewartii subsp. stewartii карантинного патогена в образцах листьев кукуру