IDENTIFICACIÓN DE LOCI MICROSATÉLITES A PARTIR DEL TRANSCRIPTOMA DE Calophyllum brasiliense (Calophyllaceae)

Calophyllum brasiliense es un árbol perennifolio que se distribuye desde el Sur de México hasta el Noreste de Argentina. Las poblaciones descritas en Argentina, localizadas en las provincias de Corrientes y Misiones, se encuentran fragmentadas por acción antrópica. Las caracterizaciones genéticas disponibles fueron realizadas mediante marcadores moleculares dominantes. No obstante, se requiere el uso de marcadores con alto valor informativo para contribuir a la conservación de estas poblaciones. En el presente trabajo, utilizando Msatcommander, se identificaron y caracterizaron loci microsatélites en C. brasiliense a partir del primer transcriptoma recientemente disponible para esta especie. Se optimizaron criterios de búsqueda para la identificación de los SSRs entre ellos: el motivo de repetición (di/tri/tetranucleotídico), el número mínimo de repeticiones (8/7/6 respectivamente) usando como referencia las unidades de repetición publicadas para C. inophyllum. Se escogieron aquellos SSRs que demostraron algún nivel de polimorfismo (2 a 4 alelos) en el transcriptoma de C. brasiliense, identificándolos mediante el software BioEdit y, utilizando Primer3 se diseñaron cebadores para la amplificación de 30 loci microsatélites. Los cebadores fueron diseñados para generar amplicones en tres rangos de tamaños: 150-262, 300-466, 500-689 pb. En el presente trabajo se describen por primera vez cebadores que revelan marcadores co-dominantes específicos que facilitarán la evaluación de la estructura genética de las poblaciones de C. brasiliense a lo largo de toda su distribución.