Estudio de asociacion con caracteres de calidad de carne y marcadores SNP en regiones relacionadas con genes diferencialmente expresados en dos musculos en la raza bovina Avilena-Negra Iberica

Con el objetivo de identificar regiones del genoma asociadas a algunos caracteres de calidad de carne en la raza Avileña Negra-Ibérica (ANI) en dos músculos, se han tenido en cuenta la posición en el genoma de 205 genes diferencialmente expresados (DE) entre el Psoas major y Flexor digitorum en esta misma raza. Se dispuso de genotipos de 397 terneros de raza Avileña-Negra Ibérica obtenidos con la plataforma Illumina Bovine SNP50. Los marcadores con un "call rate" menor del 98% o fijados fueron excluidos del análisis. Los caracteres incorporados en el análisis fueron dos caracteres organolépticos (Flavor y Terneza) y dos caracteres laboratoriales (Grasa intramuscular y Terneza instrumental). Para el análisis de asociación se utilizó un total de 3110 marcadores que bien estaban contenidos en los genes DE (104 marcadores) o en las zonas flanqueantes a dichos genes en una ventana de 500kb. El análisis estadístico se realizó con QXPak 5.0. Se encontraron en total veinte marcadores asociados a las características estudiadas, de los cuales 12 se asociaron a grasa intramuscular, cinco a terneza organoléptica y tres a terneza instrumental. Estos marcadores corresponden a 23 genes DE distribuidos en las zonas flanqueantes (22) y contenidos dentro de genes DE (1). No se encontraron marcadores asociados a flavor. Tampoco se encontraron coincidencias de marcadores entre los caracteres ni entre músculos. PALABRAS CLAVE: Marcadores, terneza organoléptica, terneza instrumental, grasa intramuscular In order to identify regions of the genome associated with some meat quality traits in the Avileña Negra-Ibérica (ANI) breed in two muscles, the genomic regions cointainig the 205 genes differentially expressed (DE) between Psoas major y Flexor digitorum in this breed were taken into account. Genotypes of 397 ANI calves with the Illumina Bovine 50K SNP platform were available. Markers with a call rate bellow 98% or fixed were excluded from the analysis. A total of 3110 markers were within the DE genes (104) or within the flanking regions of the same genes. The traits included in the analysis were two sensory traits (flavor and tenderness) and two laboratory measurements (intramuscular fat and instrumental tenderness). The software used for the analysis was QXPak 5.0. Twenty markers were found to be associated with intramuscular fat (12), tenderness (5) and instrumental texture (3). None of the markers were associated to more than one character and in both muscles to the same tra