Les gènes de la famille des lipases : comparaison des séquences nucléiques et protéiques

Les apolipoprotéines du plasma des Vertébrés et plusieurs lipases de leur métabolisme présentent des homologies de séquences qui permettent de les grouper en familles de gènes. La famille des gènes des apolipoprotéines à 4 exons comprend neuf gènes humains : le degré de divergence de ces séquences permet de situer l'origine du gène ancestral commun très haut dans l'arbre de l'évolution. Toutefois, une duplication récente du gène de l'apolipoprotéine C-I remontant à 40 millions d'années1 peut constituer un marqueur phylogénétique contemporain de la radiation principale des Singes. La lipase pancréatique' et ses isoenzymes, la lipoprotéine lipase1, la triglycéride lipase hépatique1 constituent aussi par leurs homologies une « superfamille » de gènes à laquelle on rattache également les « yolk proteins » des œufs de Diptères. Les homologies de séquence des PL, des LPL et des HL sont analysées et comparées grâce à des alignements multiples d'acides aminés et de nucléotides sur des feuilles de tableur. Dans ces comparaisons, on peut caractériser quatre sortes de marqueurs phylogénétiques :1)des séquences d'ADN répétitif (Alu, BI, PRE-1) apparues au cours de l'évolution des Mammifères ;2) des insertions et des délétions courtes (extrémités N-terminales) et la conversion du signal-peptide chez le Cobaye ; 3)une réduction progressive du nombre des introns au cours de l'évolution des lipases ; 4)plusieurs duplications ayant conduit aux cinq gènes de cette superfamille actuellement connus dans le génome humain. Vertebrates' plasmatic apolipoproteins and a few number of lipases in their metabolism present sequence homologies. They are grouped in genes families. The four exons apolipoproteins gene family includes nine human genes : the divergence rate of their sequences allows to place the first ancestral gene very high in the phylogenetic tree of the evolution. However, a more recent duplication of apolipoprotein C-I gene dating from 40 millions years1, may be a phylogenetic marker for the radiation of Monkeys. Pancreatic lipase1 and isoforms, lipoprotein-lipase1 and hepatic triacylglycerol-lipasel form by their homologies a « superfamily » of genes, which also includes yolk proteins of Dipterians eggs. Sequence homologies of PL, LPL and HL are analysed and compared with multiple alignments of amino-acids and nucleotides on spreadsheets. From these comparisons we may characterize four classes of phylogenetic markers :1)repetitive DNA sequence (Alu, B1, PRE-1) appeare