Genska karakterizacija puranskih astrovirusa dokazanih u hrvatskim jatima peradi

Opisana je identifikacija i genska karakterizacija puranskih astrovirusa (TAstV) dokazanih lančanom reakcijom polimerazom (PCR) u hrvatskim jatima purića i pilića. Organi uzorkovani od 16 jata purića i 7 jata pilića pretraženi su specifičnim početnicama na prisutnost puranskoga astrovirusa-1 (TAstV-1) i puranskoga astrovirusa-2 (TAstV-2). TAstV-1 dokazan je u 6 jata purića, a TAstV-2 u 4 jata purića i 2 jata pilića, što predstavlja prvi nalaz astrovirusa puranskog podrijetla u novog domaćina-kokoši. Umnoženi odsječci polimeraze bili su sekvencirani i analizirani. Filogenetska analiza temeljena je na sravnjivanju 82 aminokiseline izvedene iz 250 nukleotida (nt) sekvencije ORF 1b od ukupno 18 izolata puranskog astrovirusa. Molekulska i filogenetska analiza otkrile su postojanje jednog genotipa TAstV-2 i dva genotipa TAstV-1 dokazanih u komercijalnim jatima peradi u Hrvatskoj. Polimeraza je unutar obje skupine astrovirusa pokazala visoki stupanj postojanosti.