Povezanost varijacija gena STAT5B sa proizvodnjom mlijeka i svojstvima mastitisa u mliječnih goveda

Proizvodnja i zdravlje vimena su zahtjevna svojstva u uzgoju mliječnih goveda. Cilj je ovog rada bio je istražiti povezanost polimorfizma pojedinačnih nukleotidnih (SNPs) gena STAT5B u mliječnih goveda sa svojstvima proizvodnje mlijeka i mastitisa. Istraživanje je uključilo 201 kravu s četiri mliječne farme iz pokrajine Khyber Pakhtunkhwi u Pakistanu, među kojima su bile jedinke čistokrvnih pasmina (Holstein Friesian, Jersey i Achai) i križanci. U uzorcima mlijeka analizirani su broj somatskih stanica (SCC) i sastav mlijeka (postotak masnoće, proteina i laktoze). Generalizirani linearni model, uz uporabu SAS statističkog programa, poslužio je za analizu povezanosti. Sekvenciranje DNA pokazalo je fond od četiri (tri sinonimna i jedan 3/ UTR) SNP-a u genu STAT5B. Ovi su pojedinačni nukleotidni polimorfizmi dodatno potvrđeni u svim uzorcima DNA primjenom testa SNaPshot. Analiza pasmina pokazala je da većina SNP-a odgovara Hardy-Weinbergovoj ravnoteži (P>0,05). Istraživanje povezanosti pokazalo je znakovito veći postotak proteina u genotipu TT i manji broj SCC-a u CC genotipu SNP-a 1 (ekson 2, C > T), dok je u SNP-u 2 (ekson 16, T > C), genotip TT pokazao znakovito manji broj SCC-a i SCS-a u usporedbi s drugim genotipovima (P < 0,05). SNP 4 (3/ UTR, C>T) pokazao je znakovito manji broj SCC-a i učestalost kliničkog mastitisa u heterozigotnog (CT) genotipa u usporedbi s homozigotnim genotipovima. In silico predikcija pokazala su promjene u RNA sekundarnoj strukturi za SNP 2 i SNP 3. Rezultati pokazuju da bi se STAT5B trebao uzeti u obzir kao kandidatni gen, a njegove varijante kao koristan genski biljeg za poboljšanje sastava mlijeka i zdravlja vimena.