Određivanje i validacija novih početnica za učinkovitu genotipizaciju životinjskih rotavirusa G3

U radu je opisan problem neuspjeha genotipizacije životinjskih rotavirusa s dosadašnjim početnicama za genotipizaciju G3. Za rješavanje tog problema vrednovane su objavljene i rabljene početnice za G3 sa sekvencijama za VP7 područja genotipizacije izolata rotavirusa podrijetlom od ljudi i životinja. Analiza poravnanja sekvencije pokazala je da rabljene početnice G3 pokazuju veću komplementarnost s izolatima rotavirusa genotipa G6, G8 i G10. Postojeće početnice G3 bile su u devet nukleotida nepodudarne s rotavirusima G3 životinjskog podrijetla. Preinačene početnice za genotipizaciju G3 pokazale su se uspješnima za umnožavanje sva tri izolata G3 podrijetlom od životinja bez pogrješnog umnožavanja bilo kojeg genotipa skupine A rotavirusa odnosno G6 i G10. Preporučuje se upotreba predloženih početnica u molekularnim istraživanjima za dokaz uistinu dominantnih genotipova rotavirusa u životinja.