Outil de détection de Fusarium oxysporum f. sp. cyclaminis et biocontrôle de la Fusariose du cyclamen

Fusarium wilt of cyclamen is one of the most damaging diseases of cyclamen caused by the soil-bornefungus Fusarium oxysporum f. sp. cyclaminis. This disease leads to the death of cyclamens. Losses canreach more than 50% of the production. Presently no methods for fusarium control are available. In thiscontext, a project was developed in collaboration with ASTREDHOR the French institute of horticulture,INRA of Dijon and the company Agrene. The project had two goals: i) designing a Fusarium oxysporumf. sp. cyclaminis specific molecular marker allowing to detect the disease, and ii) identifying efficientbiological control agents. A specific molecular marker was identified by random amplified polymorphic DNA within a collection of strains representative of F. oxysporum f. sp. cyclaminis diversity. A specificprimer pairs was designed and validated on a large multi-taxa collection of fungal strains. This pair ofprimers specifically detects the pathogenic fungus in the plant regardless of its phenological stage or inthe substrate and the fertilization solution, making it a powerful molecular tool for prophylaxis and earlydiagnosis. Alongside, greenhouse bioassays were performed to test putative bacterial and fungalbiocontrol agents (BCA), alone or in combination. Two products were selected for the ability to reducethe disease but validation is required before they are used in production. La fusariose vasculaire du cyclamen est une maladie causée par le champignon tellurique Fusariumoxysporum f. sp. cyclaminis. C’est une des maladies majeures du cyclamen qui conduit inévitablementà la mort de la plante. En cas d’infestation, des pertes peuvent atteindre jusqu’à 50 % de la production.Actuellement, il n’existe pas de moyens de lutte contre cette maladie. C’est dans ce contexte que leprojet FuCy a débuté, associant l’institut technique de l’horticulture, ASTREDHOR, l’INRA de Dijon et lasociété Agrene. Les objectifs de ce programme étaient d’identifier un marqueur spécifique de la formespéciale cyclaminis pour développer un outil de détection du pathogène et de tester des agents de luttebiologique efficace contre ce champignon du sol. Concernant l’outil moléculaire, un fragment d’ADNspécifique de l’agent pathogène a été mis en évidence par amplification aléatoire d’ADN polymorphe ausein d’une collection de souches représentatives de la diversité de F. oxysporum f. sp. cyclaminis. Uncouple d’amorces spécifiques a ainsi été élaboré et validé sur une collection de 138 so