Relación estructura-actividad de la inhibición de aminopeptidasas M1 de Escherichia coli porpeptidomiméticos derivados de la bestatina

Las enzimas ePepN y PfA-M1 son dos alanil-aminopeptidasas M1 que son blancos en el tratamiento potencial de infecciones microbianas y la malaria, respectivamente. El inhibidor clásico de las aminopeptidasas M1 es la bestatina. El peptidomimético sintético derivado de la bestatina KBE009 fue identificado previamente como un inhibidor de PfA-M1 con actividad antimalárica in vitro. El objetivo de este trabajo fue evaluar una biblioteca sintética de 10 peptidomiméticos derivados de la bestatina (KBE009) en la inhibición de ePepN y PfA-M1 recombinantes (ePepNr y PfA-M1r), y estudiar la relación estructura-actividad resultante. En primer lugar, se determinaron las principales características cinéticas de ePepNr y de la inhibición de ambas enzimas por la bestatina. Se determinó la misma actividad de ePepNr a pH 7,0 y 8,0, así como una [K.sub.M] = 72 [micrón]M frente al sustrato Leu-p-nitroanilida. Una preincubación de 5 min entre la bestatina y ePepNr es suficiente para establecer el equilibrio de inhibición, y la bestatina es un inhibidor no competitivo de la enzima con una [K.sub.i] = 2,31 [micrón]M. Por otra parte, para PfA-Mlr es suficiente un tiempo de preincubación de 15 min, la [K.sub.i] de la bestatina es 1,29 [ómicron]M y este inhibidor es competitivo. Aunque ningún compuesto es un inhibidor potente, las características estructurales de los peptidomiméticos derivados de la bestatina (KBE009) que son favorables para la inhibición son: los grupos central isopropilo y terminal 3 -fenilpropilo en la ramificación (para ambas aminopeptidasas), los grupos central isopropilo y terminal ciclohexil (para ePepNr), y los grupos central 2-furilo y terminal bencilo (para PfA-M1r). El compuesto KBE053, como representante de esta serie, es un inhibidor incompetitivo de ePepNr con una [K.sub.i] = 10,13 [micrón]M. Este conocimiento pudiera contribuir al diseño de nuevos inhibidores de ePepN y PfA-M1.