IMPROVED IS6110 BASED MOLECULAR DETECTION OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

The detection of the IS6110 insertion element in a clinical specimen is a rapid way of diagnosing infection by Mycobacterium tuberculosis. A reliable diagnostic test for tuberculosis based on the IS6110 DNA is described in this disclosure. A "Universal" specimen preparation protocol that eliminates live organisms and purifies nucleic acids from all types of clinical specimens is described. Two nucleic acid primers designed to amplify IS6110 DNA with high specificity in a polymerase chain reaction are also described. The amplified IS6110 DNA is identified by a restriction endonuclease and electrophoresis based assay. The identification process also renders the DNA unamplifiable in a subsequent PCR, thereby reducing the possibility of contaminating other specimens. Time, labor and cost are minimized, while user safety and test reliability are maximized. The complete DNA extraction, amplification and analysis is accomplished with ease within an 8 hour period, with a sensitivity of 92 % and a specificity approaching 100 %. Testing of serially obtained samples from the same patient increases the overall rate of detection to 100 %. La détection de l'élément d'insertion IS6110 dans un échantillon clinique constitue une façon rapide de diagnostiquer une infection occasionnée par le mycobacterium tuberculosis. Cette invention, qui a trait à une épreuve diagnostique fiable de la tuberculose faisant intervenir l'ADN de IS6110, porte sur un protocole "universel" de préparation de l'échantillon éliminant des organismes vivants de tous les types d'échantillons cliniques et séparant des acides nucléiques de ces derniers. L'invention concerne également deux amorces d'acide nucléique destinées à une amplification à haute spécificité de l'ADN de l'élément d'insertion IS6110 dans une réaction d'amplification PCR. On identifie l'ADN amplifié d'IS6110 à l'aide d'une endonucléase de restriction et par une analyse faisant appel à une électrophorèse. Ce processus d'amplification rend également l'ADN non amplifiable dans une PCR ultérieure, réduisant de ce fait les possibilités de contamination d'autres échantillons. On réduit ainsi au minimum, le temps passé, le volume de travail et les coûts exigés pour cette épreuve tout en maximisant sa sécurité et sa fiabilité. On exécute aisément une extraction, une amplification et une analyse complètes d'ADN sur une durée de huit heures, avec une sensibilité de 92 % et une spécificité approchant les 100 %. Le fait de soumettre à une épreuv