METHOD FOR ISOLATING XYLANASE GENE SEQUENCES FROM SOIL DNA, COMPOSITIONS USEFUL IN SUCH METHOD AND COMPOSITIONS OBTAINED THEREBY

Xylanase DNA is recovered from soil by PCR amplification using degenerate primers. Because of the complexity of the soil samples, it is likely that the recovered product will include more than one species of polynucleotide. These recovered copies may be cloned into a host organism to produce additional copies of each individual species prior to characterization by sequencing. Recovered DNA which is found to vary from known xylanases can be used in several ways to facilitate production of novel xylanases for industrial application. First, the recovered DNA, or probes corresponding to portions thereof, can be used as a probe to screen DNA libraries and recover intact xylanase genes including the unique regions of the recovered DNA. Second, the recovered DNA or polynucleotides corresponding to portions thereof, can be inserted into a known xylanase gene to produce a recombinant xylanase gene with the sequence variations of the recovered DNA. L'ADN de xylanase est récupéré dans le sol par amplification PCR au moyen d'amorces dégénérées. Du fait de la complexité des échantillons de sol, il est vraisemblable que le produit récupéré inclura plus d'une espèce de polynucléotide. Ces copies récupérées peuvent être clonées dans un organisme hôte; on obtient ainsi des copies supplémentaires de chaque espèce particulière avant sa caractérisation par séquençage. L'ADN récupéré dont on observe qu'il varie par rapport aux xylanases connues peut être utilisé de plusieurs façons pour faciliter la production de nouvelles xylanases pour une application industrielle. D'abord, l'ADN récupéré, ou les sondes correspondant à des parties de celui-ci, peut être utilisé comme sonde pour cribler des banques d'ADN et récupérer des gènes de xylanase intacts comprenant les régions uniques de l'ADN récupéré. Ensuite, l'ADN récupéré ou les polynucléotides correspondant à des parties de celui-ci peuvent être insérés dans un gène de xylanase connu, ce qui produit un gène de xylanase de recombinaison présentant les variations de séquence de l'ADN récupéré.