SEQUENCING OF OLIGOSACCHARIDES

The present invention relates to the analysis of unknown oligosaccharides and more particularly the form of analysis in which an unknown oligosaccharide is sequentially brought together with different agents which cause monosaccharides to be cleaved from (or chemically bound to) the oligosaccharide. If cleavage occurs, the monosaccharide will subsequentially be detected in the products of the experiment thus confirming that the monosaccharide was attached to the unknown oligosaccharide and providing a means of determining the structure of the unknown oligosaccharide. After some initial analysis has been performed to provide basis structural information about the unknown oligosaccharide, the invention uses knowledge of the biosynthetic pathways which can be involved in building up oligosaccharide structures from a series of basic structures, to determine all the possible structures that an unknown oligosaccharide structure might be. Each of these possible structures is then considered in relation to each of the available sequencing agents and a numerical value assigned to each possible reaction to calculate the reaction likely to yield the most information about the structure of the unknown oligosaccharide. La présente invention se rapporte à l'analyse d'oligosaccharides inconnus et plus particulièrement à un type d'analyse dans lequel un oligosaccharide inconnu est séquentiellement mis en contact avec différents agents provoquant un clivage (ou une liaison chimique) entre des monosaccharides et l'oligosaccharide. Si le clivage se produit, le monosaccharide sera par la suite détecté dans les produits de l'expérience, confirmant ainsi que le monosaccharide était combiné à l'oligosaccharide inconnu, et assurant un moyen de détermination de la structure de l'oligosaccharide inconnu. Après avoir effectué une première analyse apportant des informations structurales de base concernant l'oligosaccharide inconnu, on se sert de processus biosynthétiques qui peuvent être liés à la construction de structures d'oligosaccharides à partir d'une série de structures de base, afin de déterminer toutes les structures possibles que pourrait présenter une structure d'oligosaccharide inconnu. Chacune de ces structures possibles est ensuite examinée par rapport à chacun des agents de séquençage existants et une valeur numérique est appliquée à chaque réaction possible afin de calculer la réaction susceptible de donner le maximum d'informations concernant l'oligosaccharide inconn